棉花咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因的克隆及表达 |
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引用本文: | 倪志勇,吕萌,马文静,陈艳,范玲. 棉花咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因的克隆及表达[J]. 西北植物学报, 2009, 29(10) |
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作者姓名: | 倪志勇 吕萌 马文静 陈艳 范玲 |
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作者单位: | 新疆农业科学院,核技术生物技术研究所,乌鲁木齐,830091 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目,国家"863"项目,新疆自治区高技术研究发展计划项目,农业部转基因重大专项课题 |
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摘 要: | 根据棉花纤维特异表达cDNA文库分析得到的咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)基因EST序列设计引物,采用RT-PCR技术首次从棉花中克隆了一个CCoAOMT基因,命名为GhCCoAOMT1(GenBank登录号为FJ848871).研究结果表明:GhCCoAOMT1基因cDNA全长960 bp,具有一个753 bp的开放阅读框,5'非编码区为9 bp,3'非编码区为198 bp,编码250个氨基酸,预测分子量约为28.306 kDa,等电点为5.39.利用PCR方法克隆了GhCCoAOMT1基因的基因组序列,长度为1 311 bp,包含5个外显子和4个内含子.氨基酸同源性分析发现,GhCCoAOMT1与来自毛白杨、烟草和苎麻的CCoAOMT同源性较高.半定量RT-PCR检测表明,GhCCoAOMT1基因在棉花各个组织中都有表达,其中茎部的表达量最高,其次表达量依次为根>花瓣>子叶>10 d纤维>雄蕊>胚珠>叶.
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关 键 词: | 棉花 咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶 基因克隆 序列分析 表达分析 |
Cloning and Expression Analysis of CCoAOMT Gene from Gossypium hirsutum L. |
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Abstract: | According to results of cotton fibre preferentially expressed cDNA library analysis,primers based on EST sequence were designed.RT-PCR method was used to clone CCoAOMT gene.A gene coding for CCoAOMT,designated as GhCCoAOMT1(GenBank accession no.FJ848871)was isolated from cotton(Gossypium hirsutum L.).The full length GhCCoAOMT1 cDNA is 960 bp,including a 9 bp 5'-UTR,an ORF of 753 bp,and a 198 bp 3'-UTR.This cDNA sequence encoded a polypepide of 250 amino acid residues with a predicted molecular mass of 28.30... |
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Keywords: | Gossypium hirsutum L. caffeoyl-CoA O-methyltransferase gene cloning sequence analysis expression analysis |
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