| 云南虫生真菌粉棒束孢遗传分化研究 |
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| 引用本文： | 代永东,虞泓,陈自宏,杨俊媛.云南虫生真菌粉棒束孢遗传分化研究[J].菌物学报,2015,34(1):38-52. |
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| 作者姓名： | 代永东 虞泓 陈自宏 杨俊媛 |
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| 作者单位： | 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室 |
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| 基金项目： | 国家教育部博士点基金项目《冬虫夏草复合体居群DNA序列生态地理变异式样研究》(20125301110001);国家火炬计划产业化示范项目《云南云百草牌虫草系列产品产业化》(2013GH021540);云南省科技计划民营经济发展专项资金项目《云南虫草生物资源可持续产业化开发》(2014XA051) |
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| 摘 要： | 对云南粉棒束孢8个当地居群和蝙蝠蛾拟青霉2个当地居群进行ITS测序和RAPD扩增分析,结合Gen Bank中相关序列,对粉棒束孢开展遗传多样性、居群遗传结构及其种内分化研究。共获得大范围内地理距离远的6个居群共97条粉棒束孢ITS序列,共有33种单倍型,单倍型多样性Hd=0.546和总核苷酸多样性Pi=0.00276,显示粉棒束孢在物种水平上遗传多样性较低。云南粉棒束孢共37条序列,有14种单倍型(10种为云南特有),具有较高单倍型多样性和核苷酸多样性(Hd=0.659,Pi=0.00274);单倍型聚类和网状分支分析表明云南粉棒束孢单倍型类型丰富,遗传多样性高,暗示云南为粉棒束孢多样性分布中心之一。ITS序列分析表明,云南当地居群间遗传分化系数Fst=51.95%;RAPD分析表明,居群间遗传分化系数Gst=0.5547,基因流Nm=0.4014;说明云南当地居群粉棒束孢分化剧烈。居群遗传距离与地理距离相关性研究表明,粉棒束孢居群遗传距离与地理距离无明显相关。中性检验和失配分析表明粉棒束孢经历过近期居群扩张。结合单倍型聚类和网状分支分析,表明Hap 19为扩张建群单倍型,但原始祖先单倍型(Hap 1)依然是粉棒束孢居群中最优势单倍型(频率为48.45%),表明粉棒束孢并不存在明显的因地理原因造成的生殖隔离。值得重视的是,通过ITS单倍型和RAPD分析,支持将蝙蝠蛾拟青霉作为粉棒束孢异名处理。
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| 关 键 词： | ITS序列分析 RAPD扩增分析 单倍型 居群扩张 相关性 |
Genetic differentiation of an entomogenous fungus Isaria farinosa in Yunnan,China |
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| Authors: | DAI Yong-Dong;YU Hong;CHEN Zi-Hong;YANG Jun-Yuan |
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| Institution: | DAI Yong-Dong;YU Hong;CHEN Zi-Hong;YANG Jun-Yuan;Yunnan Herbal Laboratory, Institute of Herbal Biotic Resources, Yunnan University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | ITS sequence RAPD amplification haplotype population expansion correlation |
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