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责任编辑
分类号
杂志ISSN号
量化肿瘤浸润免疫细胞的分析方法研究进展
作者姓名:
王建平
霍子天
秦钧
白明泽
作者单位:
1. 重庆邮电大学大数据生物智能重庆市重点实验室;2. 北京蛋白质组学研究中心;4. 华中科技大学同济医学院附属同济医院病理科
摘 要:
免疫细胞一直被认为是维持机体平衡的重要调节因子,对肿瘤浸润免疫细胞进行量化分析有望揭示免疫系统在肿瘤中的多方面作用。本文总结了量化肿瘤浸润免疫细胞的计算方法及相关的分析工具,包括基于标志基因富集分析方法和反卷积分析方法开发的算法模型与工具,列举了它们在揭示疾病发病机制以及药物治疗反应、确定肿瘤潜在生物标志物、辨别肿瘤免疫分型中的应用,提出了它们当前存在的局限性,并针对这些局限性问题进行了分析和展望,以促进该领域的发展。
关 键 词:
肿瘤
肿瘤浸润免疫细胞(TIC)
基因集富集分析(GSEA)
反卷积
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