马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)PmHEX基因的分子克隆及表达分析 |
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引用本文: | 范闪闪,郑哲,焦钰,黄荣莲,王庆恒,邓岳文,杜晓东.马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)PmHEX基因的分子克隆及表达分析[J].基因组学与应用生物学,2018(6). |
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作者姓名: | 范闪闪 郑哲 焦钰 黄荣莲 王庆恒 邓岳文 杜晓东 |
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作者单位: | 广东海洋大学水产学院;广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心 |
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摘 要: | β-N-乙酰-己糖胺酶(beta-N-acetylhexosaminidase/beta-Hexosaminidase,HEX)是一种糖苷水解酶,在几丁质降解、N-糖基化修饰、糖复合物代谢等过程发挥重要作用。为了探究PmHEX在马氏珠母贝贝壳形成中的作用,本研究利用RACE技术克隆获得马氏珠母贝PmHEX(Pinctada fucata martensii HEX,PmHEX)cDNA全长序列并通过qRT-PCR检测其在不同组织的表达模式。结果表明,PmHEX序列全长3 812 bp,其中5'UTR为22 bp,3'UTR为364 bp,开放阅读框(ORF)为3 426 bp,编码1 141个氨基酸;预测其相对分子量为125.92 kD,理论等电点为9.06;SMART软件分析PmHEX蛋白质序列,发现它具有典型的GH20和GH20b结构域和一个碳水化合物结合结构域;多序列比对显示PmHEX与其它物种的HEX具有较高的保守性,与珠母贝HEX序列相似度高达54%;q RT-PCR表达分析显示PmHEX在外套膜各区表达量较高,且在边缘区的表达量显著高于其他组织。综上所述,PmHEX可能参与马氏珠母贝贝壳的形成过程。
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