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运用BioID技术筛选水稻GS3互作蛋白
引用本文:杜荣裕,周泽娇,冯嘉琳,刘 赛,阳辉勇,李洪清. 运用BioID技术筛选水稻GS3互作蛋白[J]. 广西植物, 2018, 38(6): 771-780
作者姓名:杜荣裕  周泽娇  冯嘉琳  刘 赛  阳辉勇  李洪清
作者单位:华南师范大学生命科学学院广东省植物发育生物工程重点实验室
基金项目:国家自然科学基金(31571759)[Supported by the National Natural Science Foundation of China(31571759)] 。
摘    要:水稻异源三聚体G蛋白系统中的非典型γ亚基GS3,是一个控制籽粒大小的主效数量效应基因座,在调节籽粒大小中发挥负调控因子的功能。BioID(proximity-dependent biotin identification)为邻近蛋白标记技术,其工作原理是生物素连接酶能使其周围的蛋白带上生物素,同时生物素又能和链霉亲和素紧密结合,所以能够利用链霉亲和素偶联的磁珠富集目标蛋白。该技术具有灵敏、高效和周期短等特点,为筛选互作蛋白提供了新方法。为了解析GS3的蛋白调控网络,该研究以水稻原生质体为材料,采用BioID技术对GS3在水稻中的互作蛋白进行了筛选。Western-blot结果表明:融合蛋白Bir AG-GS3在原生质体中成功表达并生物素化GS3邻近蛋白。使用链霉亲和素磁珠富集生物素化后的蛋白,并进行蛋白质谱测序,获得了与GS3邻近的可能存在直接或间接互作的蛋白。将获得的蛋白进行功能富集与注释,并构建蛋白-蛋白互作网络。对部分蛋白进行了BiFC验证,发现GS3可能与ICL、PPDK、RPN7和RH15发生相互作用,涉及能量代谢的调节、种子淀粉物质的储存、泛素-蛋白酶体系统以及凋亡途径等生物过程。

关 键 词:BioID   GS3   水稻   籽粒大小   互作蛋白
收稿时间:2018-04-04

Screening of interaction proteins of GS3 in rice using BioID
DU Rongyu,ZHOU Zejiao,FENG Jialin,LIU Sai,YANG Huiyong,LI Hongqing. Screening of interaction proteins of GS3 in rice using BioID[J]. Guihaia, 2018, 38(6): 771-780
Authors:DU Rongyu  ZHOU Zejiao  FENG Jialin  LIU Sai  YANG Huiyong  LI Hongqing
Affiliation:Guangdong Provincial Key Laboratory of Biotechnology for Plant Development, School of Life Sciences, South China Normal University, Guangzhou 510631, China
Abstract:
Keywords:BioID   GS3   rice   grain size   interaction proteins
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