ONCOMINE、cBioPortal和UCSC Xena的介绍,以EGFR为例 |
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引用本文: | 朱子清,李奇奇,赵晓娟,雷蕾.ONCOMINE、cBioPortal和UCSC Xena的介绍,以EGFR为例[J].基因组学与应用生物学,2018(5). |
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作者姓名: | 朱子清 李奇奇 赵晓娟 雷蕾 |
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作者单位: | 西北大学生命科学学院预防基因组医学研究所 |
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摘 要: | 随着芯片和高通量测序技术的广泛应用,在肿瘤研究领域积累了越来越多的基因组学数据,这些数据库为生物学的研究提供了便利,为临床治疗奠定了基础。文中以EGFR在恶性胶质瘤中的研究为例来演示ONCOMINE数据库、c Bio Portal数据库和UCSC Xena数据库的使用过程及相关分析比较上述三个数据库的研究侧重点,为初学者介绍上述3个数据库以便更加快速的掌握并应用于科研工作中。
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