藏羊IL-2基因的RT-PCR扩增、序列分析及蛋白结构预测 |
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引用本文: | 李颖洁,马生兰,张晓芬,冶贵生.藏羊IL-2基因的RT-PCR扩增、序列分析及蛋白结构预测[J].基因组学与应用生物学,2018(7). |
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作者姓名: | 李颖洁 马生兰 张晓芬 冶贵生 |
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作者单位: | 青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室 |
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摘 要: | 设计藏羊IL-2基因特异性引物,提取藏羊脾脏总RNA,RT-PCR技术扩增IL-2基因并测序,应用生物学软件进行序列分析及蛋白结构预测。研究表明,藏羊IL-2基因长度为405 bp,编码135个氨基酸,藏羊IL-2基因与参考绵羊(登录号:NM_001009806.1,X60148.1)、山羊(登录号:NM_001287567.1,AF307018.1,U34274.1)、藏羚羊、水牛和牦牛IL-2基因的核苷酸序列同源性依次为100.0%、99.8%、99.8%、99.3%、99.0%、99.5%、98.0%和95.8%,氨基酸序列同源性依次为100.0%、100.0%、100.0%、98.5%、98.5%、100.0%、97.0%和93.3%。蛋白结构预测研究表明,IL-2蛋白具有1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点、1个N-糖基化位点和1个白细胞介素-2信号。研究成果可为藏羊IL-2基因抗病功能的研究提供基础参考数据。
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