陆川猪GPR1基因的克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 谢婉,何剑雄,陈宝剑,关志惠,郭亚芬,兰干球,谢炳坤.陆川猪GPR1基因的克隆及生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2018(8). |
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作者姓名: | 谢婉 何剑雄 陈宝剑 关志惠 郭亚芬 兰干球 谢炳坤 |
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作者单位: | 广西大学动物科学技术学院;广西壮族自治区畜牧研究所广西家畜遗传改良重点实验室 |
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摘 要: | 本试验旨在对陆川猪G蛋白偶联受体1(G protein-coupled receptor 1,GPR1)基因进行克隆及相关生物信息学分析。本研究根据NCBI上公布的野猪GPR1基因序列设计引物,应用RT-PCR技术扩增得到包含全长编码区在内的基因片段,应用生物信息学软件对陆川猪GPR1基因的理化性质,修饰结构,二级结构和三级结构进行分析。结果显示:GPR1基因编码区全长1 068 bp,编码355个氨基酸;与NCBI上公布的野猪(NM_001190244.1)、牛(NM_001206545.1)、人(NM_005279.3)、猕猴(AF100204.1)、小鼠(NM_146250.2)、大鼠(NM_012961.1)GPR1基因氨基酸序列的同源性分别为98.9%、90.4%、86.5%、86.2%、78.2%、77.4%。陆川猪的GPR1蛋白有七个跨膜螺旋结构,不存在蛋白信号肽。GPR1蛋白存在两个N糖基化位点和多个潜在磷酸化位点。本研究成功克隆陆川猪GPR1基因完整的编码区序列,为今后GPR1基因在陆川猪的脂肪沉积及脂肪代谢方面的研究提供了理论依据。
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