牦牛KAP6-1和KAP6-4基因序列变异分析 |
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引用本文: | 石斌刚,谢建鹏,胡江,高小莉,罗玉柱,李少斌,石红梅.牦牛KAP6-1和KAP6-4基因序列变异分析[J].基因组学与应用生物学,2018(4). |
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作者姓名: | 石斌刚 谢建鹏 胡江 高小莉 罗玉柱 李少斌 石红梅 |
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作者单位: | 甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃省草食动物生物技术重点实验室;国家肉牛牦牛产业技术体系甘南综合试验站 |
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摘 要: | 角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)是毛纤维的主要结构成分。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛和野血牦牛为研究对象,应用PCR-SSCP方法检测KAP6-1和KAP6-4基因外显子序列多态性。结果表明4个牦牛群体的KAP6-1基因外显子区存在c.42TC、c.135CT的同义突变及c.173GC、c.175GT的非同义突变,导致p.Cys58Ser和p.Gly59Cys的氨基酸残基改变;另外检测到1处45 bp的插入/缺失突变导致16个氨基酸残基的插入/缺失;甘南牦牛PIC值0.222 3为低度多态,其他3个牦牛群体PIC值0.393 4~0.4672为中度多态。牦牛KAP6-4基因外显子区检测到c.51CT、c.54CA、c.78TC、c.96TC和c.135TC的同义突变,以及c.118AG的非同义突变,导致编码的氨基酸残基p.Ser40Gly的改变;4类群牦牛PIC值为0.2658~0.387 2为中度多态。聚类分析表明牦牛KAP6-1基因外显子区碱基序列与普通牛、绵羊和山羊的同源性最高,其亲缘关系和系统进化远近一致。
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