| 中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析 |
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| 引用本文： | 丁栋,沈菲菲,张保卫,李崇奇,张晨岭,周开亚,常青. 中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析[J]. 兽类学报, 2008, 28(2): 117-125 |
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| 作者姓名： | 丁栋 沈菲菲 张保卫 李崇奇 张晨岭 周开亚 常青 |
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| 作者单位： | 南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所,南京,210046;安徽大学生命科学学院,合肥,230039;海南医学院基础医学部,海口,571101 |
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| 基金项目： | 江苏省生物多样性与生物技术重点实验室基金 |
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| 摘 要： | 本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征.研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作用.在系统发生分析中,在基于核苷酸序列构建的NJ树中,野猪DRB位点的15种等位基因全部聚为一枝,没有发现跨种多态现象;而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中,野猪SLA-DRB*nnu6和人DRB基因exon 2片段聚在一起,这种氨基酸残基的高度相似可能是由于自然选择压力下产生的趋同.野猪DRB基因exon 2的序列多态性分析表明,东北野猪基因多态性低于四川野猪和华南野猪,这可能与不同气候条件和地理环境下的寄生虫等因素对SLA等位基因变异的影响存在差异有关.
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| 关 键 词： | 野猪 DRB exon 2 遗传变异 平衡选择 系统发生 |
| 文章编号： | 1000-1050(2008)02-0117-09 |
| 修稿时间： | 2007-09-12 |
Sequence variation at the swine lymphocyte antigen locus DRB exon 2 in Chinese wild boars(Sus scrofa) |
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| DING Dong,SHEN Feifei,ZHANG Baowei,LI Chongqi,ZHANG Chenling,ZHOU Kaiya,CHANG Qing. Sequence variation at the swine lymphocyte antigen locus DRB exon 2 in Chinese wild boars(Sus scrofa)[J]. Acta Theriologica Sinica, 2008, 28(2): 117-125 |
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| Authors: | DING Dong SHEN Feifei ZHANG Baowei LI Chongqi ZHANG Chenling ZHOU Kaiya CHANG Qing |
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