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抑制差减杂交分离赤霉病菌诱导的小麦特异表达基因
引用本文:林凡云,陆琼娴,徐剑宏,杨慧勇,祭芳,史建荣.抑制差减杂交分离赤霉病菌诱导的小麦特异表达基因[J].西北植物学报,2008,28(3):433-439.
作者姓名:林凡云  陆琼娴  徐剑宏  杨慧勇  祭芳  史建荣
作者单位:江苏省农业科学院,食品质量安全与检测研究所,南京,210014
基金项目:江苏省农科院博士后基金项目(6510610);国家科技支撑计划(2006BAD02A16);公益性行业(农业)科研专项(nyhyzx07-048)
摘    要:为了全面探索小麦赤霉病抗性机理,以抗赤霉病小麦品种‘苏麦3号’及其感病的近等基因系(Hwo4)为实验材料,构建了一个‘苏麦3号’受赤霉病菌诱导表达的正向差减杂交文库。随机选取了141个阳性克隆测序,共获得133条通读EST。将获得的EST去除载体及接头序列后,利用CAP3软件进行聚类分析,133条EST被聚成90个序列重叠群(contigs),片段大小介于106~643 bp间,平均长度为274 bp。利用NCBI的Blastx软件对序列进行蛋白序列同源性比对,结果显示76条序列在蛋白数据库中可以找到同源序列,功能涉及能量代谢、物质代谢、疾病/防御、转录及细胞结构等。其中以能量及物质代谢相关的基因数量最多,分别占总EST的21.1%及17.1%;其次是与抗病及防御反应有关的EST,数量占总EST的15.8%。进一步的分析表明与抗病及防御相关的EST功能主要涉及抗氧化、细胞解毒及相关物质的代谢。

关 键 词:小麦  赤霉病菌  抑制差减杂交
文章编号:1000-4025(2008)03-0433-07
修稿时间:2007年12月17

Isolation of Genes Involved in the Response of Wheat to Fusarium graminearum by Means of Suppression Subtractive Hybridization
LIN Fan-yun,LU Qiong-xian,XU Jian-hong,YANG Hui-yong,JI Fang,SHI Jian-rong.Isolation of Genes Involved in the Response of Wheat to Fusarium graminearum by Means of Suppression Subtractive Hybridization[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2008,28(3):433-439.
Authors:LIN Fan-yun  LU Qiong-xian  XU Jian-hong  YANG Hui-yong  JI Fang  SHI Jian-rong
Abstract:
Keywords:wheat  Fusarium graminearum  suppression subtractive hybridization
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