福建省2012-2020年麻疹野毒株分子流行病学分析

为了解2012-2020年福建省麻疹野毒株病毒核蛋白N基因及H基因的变化，探讨其流行规律，本研究收集2012年-2020年福建省各地市级麻疹风疹网络实验室检测麻疹病毒核酸阳性的麻疹疑似病例咽拭子标本开展病毒分离，应用RT-PCR方法扩增MV的N基因羧基末端450个核苷酸片段并进行序列测定，通过与WHO推荐24个麻疹病毒基因型参考株、中国S(Shanghai，上海)191疫苗株、H1a中国代表株（China93-2）进行对比分析，从2012-2020年共收到1217例麻疹核酸检测阳性的疑似麻疹病例的病原学标本中，共分离出83株麻疹病毒野毒株，其中76株为H1a亚型，5株B3基因型，2株D8基因型。H1a亚型可分为2个独立谱系Lineage1～2,MV H1a基因型毒株间核苷酸及氨基酸同源性为99.82%～99.98%和99.91%～100%。2018年及2019年福建省首次分离到B3基因型麻疹病毒及D8基因型麻疹病毒为输入性基因型，B3基因型毒株高度同源，D8基因型毒株同源性100%。H1a基因型为福建省本土野毒株优势基因亚型，不同地区不同年代存在同一野毒株持续循环，同一地区同一年份也具...