α-变形菌纲新的保守特征性插入缺失 |
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作者姓名: | 吕志堂 王静 周燕霞 张维维 |
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作者单位: | 1.河北大学 生命科学学院 河北省微生物多样性研究与应用实验室,河北 保定 071002;2.药物化学与分子诊断教育部重点实验室(河北大学),河北 保定 071002,河北大学 生命科学学院 河北省微生物多样性研究与应用实验室,河北 保定 071002,河北大学 生命科学学院 河北省微生物多样性研究与应用实验室,河北 保定 071002,河北大学 生命科学学院 河北省微生物多样性研究与应用实验室,河北 保定 071002 |
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基金项目: | 河北省生物工程重点学科建设项目(1050-5030023);河北省生物学强势特色学科建设项目(1050-5030004) |
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摘 要: | 在基于16S rRNA基因的分类系统中α-变形菌被定为变形菌门的一个纲。本文根据系统发育基因组学分析,首次发现并鉴定了α-变形菌纲普遍存在的5个保守特征性插入缺失(CSIs)。23S rRNA基因具有1个98~105 nt的特征性缺失和1个5~7 nt的特征性插入,DNA复制解旋酶(DnaB)具有1个17~29 aa的特征性插入,精氨酰-tRNA合成酶(ArgRS)具有1个15 aa的特征性插入,DNA促旋酶A亚基(GyrA)具有1个27~63 aa的特征性插入。α-变形菌纲的这些CSIs使得该纲与包括变形菌门其他纲在内的其他细菌显著区分开来,为该群细菌系统发育及系统分类研究提供了可靠手段。
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关 键 词: | α-变形菌纲;保守特征性插入缺失;系统发育基因组学 |
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