| 基于转录组学和代谢组学联合分析草珊瑚萜类化合物生物合成的组织特异性分布 |
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| 引用本文： | 吴迪,张燕燕,林楠,魏艺聪. 基于转录组学和代谢组学联合分析草珊瑚萜类化合物生物合成的组织特异性分布[J]. 生物工程学报, 2024, 40(2): 542-561 |
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| 作者姓名： | 吴迪 张燕燕 林楠 魏艺聪 |
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| 作者单位： | 福建中医药大学药学院, 福建 福州 350122 |
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| 基金项目： | 福建省自然科学基金(2020J013) |
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| 摘 要： | 本研究旨在探究草珊瑚叶和根中萜类化合物的组织特异性分布差异，解析其药效品质差异形成的分子机制。采用液相色谱-质谱联用技术(liquid chromatography-mass spectrometry, LC-MS)和Illumina HiSeqTM高通量测序技术获得草珊瑚[Sarcandra glabra (thunb) naka]叶和根的代谢组学和转录组学数据。代谢组学结果表明参与叶和根中萜类合成的差异代谢物有50个，包括法尼西基半胱氨酸、甘油醛-3-磷酸、甲羟戊酸-5-磷酸等。转录学结果表明差异代谢酶基因有57条，包括ACTC、HMGCR、MVK、DXS与KS等，并预测了MYB、C2H2、AP2/ERF-ERF等7个转录因子参与调控草珊瑚不同组织部位中萜类的合成和积累差异。实时荧光定量PCR (quantitative real-time polymerase chain reaction, qRT-PCR)结果显示，随机选取的8个参与萜类合成的酶基因在草珊瑚不同组织部位中的表达趋势与转录组学测序结果一致。本研究有助于阐明草珊瑚叶和根临床疗效差异形成的分子机制，同时为草珊瑚的资源开发利用奠定基础。
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| 关 键 词： | 草珊瑚 萜类 代谢组学 转录组学 |
| 收稿时间： | 2023-05-17 |
| 修稿时间： | 2023-08-07 |
Tissue specific distribution of terpenoid biosynthesis in Sarcandra glabra based on transcriptome and metabolome analysis |
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| WU Di,ZHANG Yanyan,LIN Nan,WEI Yicong. Tissue specific distribution of terpenoid biosynthesis in Sarcandra glabra based on transcriptome and metabolome analysis[J]. Chinese journal of biotechnology, 2024, 40(2): 542-561 |
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| Authors: | WU Di ZHANG Yanyan LIN Nan WEI Yicong |
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| Affiliation: | College of Pharmacy, Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350122, Fujian, China |
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