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野生稻Oryza nivara和O. rufipogon DNA甲基化多样性
引用本文:崔影影,张大明.野生稻Oryza nivara和O. rufipogon DNA甲基化多样性[J].生物多样性,2010,18(3):227-450.
作者姓名:崔影影  张大明
作者单位:中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室, 北京 100093
摘    要:本文调查研究了野生稻群体内及群体间的DNA甲基化多样性。选取与亚洲栽培稻近缘的两个野生种Oryza nivaraO. rufipogon作为研究对象, 采用改进的MSAP (methylation-sensitive amplification polymorphism)技术对其基因组CCGG位点的甲基化多样性进行了分析。结果表明: 在同一个IRGC(the International Rice Germplasm Center)编号群体内的不同个体间, 基因组甲基化条带高度一致; 而在不同编号群体间, 甲基化条带表现为多态。其中后者又可以分为两类: 条带模式高度一致的Class I和条带模式呈多态性的Class II。将上述两类甲基化片段的编码基因与栽培稻粳稻(O. sativaL. subsp. japonica)和籼稻(O. sativa L. subsp. indica)两个亚种的同源基因进行序列比对发现, 在进化趋势上Class I表现得比较保守, 而Class II较为活跃。DNA甲基化多样性作为标志遗传多样性的一种信息来源, 其在群体分化及物种进化过程中的作用还需要进一步探讨。

关 键 词:表观等位基因  MSAP  群体分化  进化  
收稿时间:2009-10-19

Surveying DNA methylation diversity in the wild rice,Oryza nivara and O.rufipogon
Yingying Cui,Daming Zhang.Surveying DNA methylation diversity in the wild rice,Oryza nivara and O.rufipogon[J].Biodiversity Science,2010,18(3):227-450.
Authors:Yingying Cui  Daming Zhang
Institution:State Key Laboratory of Systematic and Evolutionary Botany, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093
Abstract:Intra-and inter-population methylation diversity at CCGG sites were surveyed in the genomes of Oryza nivara and O. rufipogon using a modified MSAP (methylation-sensitive amplification polymorphism) technique. These two wild species were closely related to cultivated rice in that they share the common A genome. Results revealed that methylated bands were uniform among different individuals of the same IRGC (International Rice Germplasm Center) accession, but polymorphic among different populations within the...
Keywords:epialleles  MSAP  population differentiation  evolution  
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