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病毒诱发哮喘关键miRNA靶基因的预测与验证及潜在中药干预
作者姓名:周智  姚冰  王孟清  罗银河  胡燕  丁伊  邓羿駃  刘靖雷  马啸
作者单位:1. 湖南中医药大学;2. 长沙市妇幼保健院;3. 湖南中医药大学第一附属医院湖南中医药大学中医学国内一流建设学科;4. 长沙市民政职业技术学院
摘    要:目的:探究病毒诱发哮喘关键微小RNA(mi RNA)以及差异基因在哮喘发病中的调控作用,并寻找潜在的治疗靶点以及对应中药,为病毒诱发哮喘中医药辨证论治、早期截断哮喘的发生、传变提供诊疗思路。方法:首先通过查阅有关mi RNA与哮喘关系的文献,根据文献的影响因子、报道次数及与呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus, RSV)、树突细胞、自噬等病毒诱发哮喘发病机制的密切程度进行积分统计,按得分高低筛选出6个候选mi RNA:mi RNA-155、mi RNA-21、Let-7、mi RNA-34a、mi RNA-145、mi RNA-146a。然后通过靶基因数据库分析其功能,并通过生物信息学方法筛选出与关键目标mi RNA相关的信号通路。最后通过Coremine数据库查找核心基因对应中药,使用TCMSP、BATMAN-TCM数据库查找中药有效成分,利用Cytoscape软件进行可视化分析,并进行基因本体论(Gene ontology,GO)富集分析与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路...

关 键 词:儿童哮喘  呼吸道合胞病毒  靶基因  生物信息学  中医药  数据挖掘
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