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相对定量和绝对定量-以CsSAMDC基因表达分析为例
引用本文:张吉宇,王彦荣,南志标.相对定量和绝对定量-以CsSAMDC基因表达分析为例[J].中国生物工程杂志,2009,29(8).
作者姓名:张吉宇  王彦荣  南志标
作者单位:兰州大学草地农业科技学院,兰州,730020
基金项目:国家重点基础研究发展规划(973计划),科技部国际科技合作重点项目,国家科技支撑计划,甘肃省国际科技合作重点项目计划 
摘    要:以无芒隐子草干旱诱导的cDNA文库中获得的SAMDC序列为基础,应用实时荧光定量RT-PCR技术同时结合相对定量和绝对定量方法,以分析无芒隐子草SAMDC基因在不同组织、不同胁迫梯度下的表达为案例,详细介绍并比较相对定量和绝对定量在基因表达方面的应用.分别采集无芒隐子草幼苗自然干旱0,2,4,6,8,10d以及恢复浇水1,4d的叶片和根系材料,相对定量采用2-ΔΔCT.法;以相应基因的质粒扩增产物为标准品制作标准曲线,对定量PCR的引物浓度进行了优化,而后筛选最稳定的内参基因,以内参基因获得的标准化因子对绝对定量数据进行标准化.相对定量2-ΔΔCT法结果显示CsSAMDC基因在干旱胁迫8d后,叶片中的表达量为胁迫前的0.62±0.13倍,根中的表达量为胁迫前的5.93±0.71倍.绝对定量表明,CsSAMDC基因只在胁迫第8d和第10d的根组织中检测到表达量显著增大,胁迫第4~6d和恢复浇水后1~4d,CsSAMDC基因在叶和根组织中的表达较对照降低.相对定量和绝对定量在DsSAMDC基因表达研究中显示相对一致的趋势.

关 键 词:无芒隐子草  相对定量  绝对定量

Relative and Absolute Quantification-Expression Analysis of CsSAMDC Gene As a Case
ZHANG Ji-yu,WANG Yan-rong,NAN Zhi-biao.Relative and Absolute Quantification-Expression Analysis of CsSAMDC Gene As a Case[J].China Biotechnology,2009,29(8).
Authors:ZHANG Ji-yu  WANG Yan-rong  NAN Zhi-biao
Abstract:
Keywords:SAMDC
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