| 地黄核苷二磷酸激酶基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李冰怡,李谦谦,宫世萌,李娇娇,郑 雪,段红英. 地黄核苷二磷酸激酶基因的克隆及生物信息学分析[J]. 广西植物, 2020, 40(4): 492-500 |
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| 作者姓名： | 李冰怡 李谦谦 宫世萌 李娇娇 郑 雪 段红英 |
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| 作者单位： | 河南师范大学 生命科学学院, 河南 新乡 453000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31870312,31500262); 河南省高校科技创新人才支持计划项目(17HASTIT034)[Supported by the National Natural Science Foundation of China(31870312, 31500262); Scientific and Technological Innovation Talent Program of College and University in Henan(17HASTIT034)]。 |
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| 摘 要： | 核苷二磷酸激酶(NDPK)是一种高度保守的多功能蛋白,具有催化底物磷酸化的作用,能够参与植物的生长发育、非生物胁迫、感病应激、光合作用和能量代谢等过程。为了解地黄核苷二磷酸激酶基因(RgNDPKⅠ)的结构、功能和性质,该研究利用地黄转录组学数据,通过电子克隆的方法获得了RgNDPKⅠ基因的全长cDNA序列,长度为765 bp。生物信息学分析结果表明,RgNDPKⅠ基因的开放阅读框长度为447 bp,编码148个氨基酸,具有典型的核苷二磷酸激酶活性结构域和其他磷酸化活性位点。RgNDPKⅠ基因编码的蛋白质定位于细胞质,是无跨膜区域的亲水性蛋白,该蛋白质与芝麻、紫花风铃的核苷二磷酸激酶相似性较高,分别为97%和96%。在多种生物中已经克隆得到了核苷二磷酸激酶基因,且不同植物核苷二磷酸激酶氨基酸序列中存在多个相似的保守结构域,推测RgNDPKⅠ基因所编码的蛋白质为核苷二磷酸激酶超家族成员。该研究结果为进一步探明RgNDPKⅠ的性质、结构、功能及表达机制提供了重要的理论依据。
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| 关 键 词： | 地黄 核苷二磷酸激酶(NDPK) 电子克隆 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2019-04-09 |
Cloning and bioinformatics analysis of nucleoside diphosphate kinase gene from Rehmannia glutinosa |
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| LI Bingyi,LI Qianqian,GONG Shimeng,LI Jiaojiao,ZHENG Xue,DUAN Hongying. Cloning and bioinformatics analysis of nucleoside diphosphate kinase gene from Rehmannia glutinosa[J]. Guihaia, 2020, 40(4): 492-500 |
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| Authors: | LI Bingyi LI Qianqian GONG Shimeng LI Jiaojiao ZHENG Xue DUAN Hongying |
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| Affiliation: | College of Life Sciences, Henan Normal University, Xinxiang 453000, Henan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Rehmannia glutinosa nucleoside diphosphate kinase(NDPK) silico cloning bioinformatics |
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