| 染色质转座酶可及性测序研究进展 |
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| 引用本文： | 吴杰,全建平,叶勇,吴珍芳,杨杰,杨明,郑恩琴. 染色质转座酶可及性测序研究进展[J]. 遗传, 2020, 0(4): 333-346 |
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| 作者姓名： | 吴杰 全建平 叶勇 吴珍芳 杨杰 杨明 郑恩琴 |
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| 作者单位： | 华南农业大学动物科学学院;仲恺农业工程学院 |
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| 基金项目： | 广东省“扬帆计划”引进创新创业团队项目(编号:2016YT03H062);广东省现代农业产业技术体系生猪创新团队项目(编号:2019KJ126);广东省自然科学基金项目(编号:2017A030313213)资助。 |
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| 摘 要： | 染色质转座酶可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,ATAC-seq)诞生于2013年,具有比脱氧核糖核酸酶I超敏感位点测序(deoxyribonuclease I hypersensitive site sequencing, DNase-seq)和微球菌核酸酶敏感位点测序(micrococcal nuclease sequencing, MNase-seq)更快速、灵敏、简便的优点,是目前分析全基因组范围染色质开放区域的热点技术。通过该技术能获得染色质开放区域的相关信息,从而映射出转录因子等调控蛋白的结合区域和核小体定位等信息,对于研究表观遗传分子机制具有重要意义。本文比较了5种获取染色质开放区域技术的优缺点,重点介绍了ATAC-seq的原理和主要流程,描述了利用ATAC-seq技术研究染色质开放区域的发展概况以及ATAC-seq的相关应用,期望对真核生物全基因组水平的染色质开放区域研究、顺式调控元件鉴定以及遗传调控网络的解析等提供借鉴。
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| 关 键 词： | 染色质转座酶可及性测序 染色质开放区域 Tn5转座酶 表观遗传修饰 转录因子 |
Advances in assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing |
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| Jie Wu,Jianping Quan,Yong Ye,ZhenFang Wu,Jie Yang,Ming Yang,Enqin Zheng. Advances in assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing[J]. Hereditas, 2020, 0(4): 333-346 |
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| Authors: | Jie Wu Jianping Quan Yong Ye ZhenFang Wu Jie Yang Ming Yang Enqin Zheng |
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| Affiliation: | (National Engineering Research Center for Breeding Swine Industry,College of Animal Science,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,China;College of Animal Science and Technology,Zhongkai University of Agriculture and Engineering,Guangzhou 510225,China) |
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