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普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析
引用本文:孙亭亭,张磊,陈乐,龚达平,王大伟,陈雅琼,陈蕾,孙玉合.普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析[J].植物遗传资源学报,2016,17(1):162-168.
作者姓名:孙亭亭  张磊  陈乐  龚达平  王大伟  陈雅琼  陈蕾  孙玉合
作者单位:1. 中国农业科学院烟草研究所/烟草行业烟草基因资源利用重点实验室,青岛,266101;2. 华中农业大学园艺林学学院,武汉,430070
摘    要:ARF(AUXIN RESPONSE FACTOR)基因含有一个B3功能域和具有转录激活或抑制活性的中心功能域,在植物发育过程中起到非常重要的作用。本研究采用生物信息学方法,根据拟南芥ARF基因序列鉴定了普通烟草基因组中的ARF基因,并对家族成员进行了序列特征、系统发生、亚细胞定位和表达模式分析。目前在普通烟草基因组中共得到50个ARF基因成员,其基因结构相对复杂,一般含有10个外显子。亚细胞定位结果表明,少数ARF蛋白定位到线粒体或叶绿体,大多数未检测到定位信号。转录组数据分析表明,ARF基因具有不同的组织表达模式,部分基因表现出组织特异性。这些研究结果为普通烟草ARF基因家族功能的深入研究奠定了基础。

关 键 词:普通烟草  ARF基因家族  系统进化  基因表达
收稿时间:2014/11/3 0:00:00
修稿时间:2014/11/27 0:00:00

Identification and Expression Analysis of the ARF Gene Family in Nicotiana Tabacum
Abstract:
Keywords:Nicotiana tabacum  ARF gene family  phylogenetic evolution  gene expression
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