普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析 |
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引用本文: | 孙亭亭,张磊,陈乐,龚达平,王大伟,陈雅琼,陈蕾,孙玉合.普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析[J].植物遗传资源学报,2016,17(1):162-168. |
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作者姓名: | 孙亭亭 张磊 陈乐 龚达平 王大伟 陈雅琼 陈蕾 孙玉合 |
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作者单位: | 1. 中国农业科学院烟草研究所/烟草行业烟草基因资源利用重点实验室,青岛,266101;2. 华中农业大学园艺林学学院,武汉,430070 |
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摘 要: | ARF(AUXIN RESPONSE FACTOR)基因含有一个B3功能域和具有转录激活或抑制活性的中心功能域,在植物发育过程中起到非常重要的作用。本研究采用生物信息学方法,根据拟南芥ARF基因序列鉴定了普通烟草基因组中的ARF基因,并对家族成员进行了序列特征、系统发生、亚细胞定位和表达模式分析。目前在普通烟草基因组中共得到50个ARF基因成员,其基因结构相对复杂,一般含有10个外显子。亚细胞定位结果表明,少数ARF蛋白定位到线粒体或叶绿体,大多数未检测到定位信号。转录组数据分析表明,ARF基因具有不同的组织表达模式,部分基因表现出组织特异性。这些研究结果为普通烟草ARF基因家族功能的深入研究奠定了基础。
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关 键 词: | 普通烟草 ARF基因家族 系统进化 基因表达 |
收稿时间: | 2014/11/3 0:00:00 |
修稿时间: | 2014/11/27 0:00:00 |
Identification and Expression Analysis of the ARF Gene Family in Nicotiana Tabacum |
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Abstract: | |
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Keywords: | Nicotiana tabacum ARF gene family phylogenetic evolution gene expression |
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