| 人管家基因启动子序列中的组合转录调控元件分析 |
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| 引用本文： | 李慧敏,石玉,杨志刚,江绍萍.人管家基因启动子序列中的组合转录调控元件分析[J].生物化学与生物物理进展,2015,42(1):73-81. |
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| 作者姓名： | 李慧敏 石玉 杨志刚 江绍萍 |
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| 作者单位： | 云南民族大学数学与计算机科学学院,郑州师范学院数学与统计学院,四川大学计算机学院,云南民族大学数学与计算机科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;云南省教育厅基金，河南省教育厅科学技术项目，云南大学理工类科研基金项目 |
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| 摘 要： | 研究表明,第一内含子可能参与基因转录调控.利用统计方法提取人管家基因上游至第一内含子序列中潜在的组合转录调控模体,分析模体间的距离、区域分布等特征,探讨内含子参与基因转录调控的可能性及其参与方式.在管家基因中共获得960对潜在转录调控模体对,其中57%与实验已知的具有转录相互作用的因子对吻合,共涉及12组因子对.分析发现,绝大多数模体对(80%)偏向于上游区域及"上游-内含子"区域,进一步支持了内含子参与基因转录调控的假设,并据此推测内含子与上游序列之间具有转录协同作用,模体在基因转录起始位点(TSS)附近较为集中,模体对的两个模体之间距离较近,60%左右距离在200 bp以内,特别地,65%的模体对特征距离在100 bp以内,短距离间隔有利于转录因子间的协同作用.这些结果将有助于对人基因转录调控机制及内含子功能的深入认识.
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| 关 键 词： | 人管家基因 组合转录调控 模体对 内含子 区域偏好 距离分布 |
| 收稿时间： | 2014/3/13 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/7/27 0:00:00 |
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