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鸭肝炎病毒基因组3'末端序列的克隆和分析
引用本文:丁春宇,张大丙.鸭肝炎病毒基因组3'末端序列的克隆和分析[J].病毒学报,2007,23(4):312-319.
作者姓名:丁春宇  张大丙
作者单位:中国农业大学,动物医学院,农业部预防兽医学重点开放实验室,北京,100094;中国农业大学,动物医学院,农业部预防兽医学重点开放实验室,北京,100094
摘    要:用3'RACE和RT-PCR扩增并克隆鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)Ⅰ型毒株C80和Ⅰ型变异株E63的3'末端序列.分析结果显示,C80株和E63株基因组3'末端均包含1 359 nt的3D、终止密码子TGA、长314nt的3'UTR,而poly(A)尾分别含18个A和19个A.由2株DHV 3D核苷酸序列所推导的3D蛋白均含453个氨基酸,均包含KDELR、DxxxxD、GxxCSGxxxTxxxNS、YGDD和FLKR等小RNA病毒RNA聚合酶的特征基序,该结果进一步证实Ⅰ型DHV属于小RNA病毒科的成员.两株DHV与小RNA病毒科9个已知属之间3D蛋白的氨基酸序列同源性为16%~37%,介于属间3D蛋白的氨基酸序列同源性范围(18%~60%)之内;此外,Ⅰ型DHV的3'UTR在小RNA病毒科是最长的.用3D蛋白进行进化分析的结果表明,Ⅰ型DHV可能属于小RNA病毒科的一个独立的病毒属.

关 键 词:鸭肝炎病毒  3D基因  3’UTR  poly(A)  3’RACE
文章编号:1000-8721(2007)04-0312-08
修稿时间:2006年11月16日

Molecular Cloning and Analysis of the 3' Terminal Sequence of Duck Hepatitis Virus Genome
DING Chun-yu,ZHANG Da-bing.Molecular Cloning and Analysis of the 3' Terminal Sequence of Duck Hepatitis Virus Genome[J].Chinese Journal of Virology,2007,23(4):312-319.
Authors:DING Chun-yu  ZHANG Da-bing
Abstract:
Keywords:3'UTR  poly(A)  3'RACE
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