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利用阵列分析水稻AP2/EREBP 家族基因的表达特性
引用本文:胡一兵,,赵利锋,,王台. 利用阵列分析水稻AP2/EREBP 家族基因的表达特性[J]. 植物学报, 2008, 25(1): 27-33
作者姓名:胡一兵    赵利锋    王台
作者单位:1 中国科学院植物研究所, 北京 100093; 2 中国科学院研究生院, 北京 100049
基金项目:,国家高技术研究发展计划(863计划),
摘    要:AP2/EREBP蛋白是广泛存在于高等植物中的且包含AP2/EREBP功能域的重要转录因子家族, 通常可分为包含单功能域的EREBP类蛋白和包含两个功能域的AP2类蛋白, 它们的功能涉及植物生长发育调控和对逆境应答等许多方面。据预测,水稻基因组编码150个左右的AP2/EREBP 家族成员, 但目前绝大多数蛋白的功能仍不清楚。为了解这些基因在水稻不同器官中的表达特性, 我们以AP2/EREBP功能域的氨基酸序列为基础, 从水稻基因组数据库中搜索到12个AP2类以及20个EREBP类预测基因, 利用PCR扩增的编码区序列制备了这些预测基因的macro-array。 以幼芽、幼根、幼叶、颖花和灌浆期成熟叶的 cDNA为探针, 杂交分析结果显示: 不同AP2类预测基因之间的表达量差别较大, 但同一个基因在不同器官中表达量基本一致; 与此不同的是, 大部分EREBP类预测基因在幼根和成熟叶片中表达量较高, 而在幼芽和幼叶中表达量较低。这些预测基因的表达模式可能与它们的功能密切相关。

关 键 词:AP2/EREBP  杂交分析  水稻  预测基因
收稿时间:2007-08-03
修稿时间:2007-10-10

Macro-array Approaches to Identify Expression Characteristics of Putative AP2/EREBP Genes of Orzya sativa
Yibing Hu,,Lifeng Zhao,,Tai Wang. Macro-array Approaches to Identify Expression Characteristics of Putative AP2/EREBP Genes of Orzya sativa[J]. Bulletin of Botany, 2008, 25(1): 27-33
Authors:Yibing Hu    Lifeng Zhao    Tai Wang
Affiliation:1Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Bei jing 100093, China 2Graduate School of Chinese Academy of Sciences, Bei jing 100049, China
Abstract:
Keywords:;
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