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金纹细蛾几丁质酶基因生物信息学分析
引用本文:范晓军,宋志芳,仙笑笑,李瑶,赵秋勇. 金纹细蛾几丁质酶基因生物信息学分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2013, 0(1): 91-96
作者姓名:范晓军  宋志芳  仙笑笑  李瑶  赵秋勇
作者单位:太原理工大学化学化工学院生物与制药工程系
基金项目:国家自然科学基金项目(31101490);山西省青年科技研究基金(2010021031-2);太原市大学生创新创业计划项目(10074)资助
摘    要:本文从生物信息学角度对克隆获得的金纹细蛾几丁质酶进行分析,通过课题组提交到GenBank的数据,采用在线分析及相应软件分析预测金纹细蛾几丁质酶(LrCHI)基因核苷酸和氨基酸序列的组成、理化性质、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、疏水性、二级结构和三级结构等,并构建系统发育树。结果表明:LrCHI开放阅读框由1737bp组成,推导578个氨基酸;此序列所编码的蛋白属于几丁质酶18家族,其N端含有信号肽和几丁质酶18家族活性位点,C端为几丁质结合区,无跨膜结构域区域;预测LrCHI为亲水性蛋白;金纹细蛾与鳞翅目的棉铃虫、甜菜夜蛾进化关系最近。分析结果可为LrCHI的科学研究提供有价值的信息,为进一步研究其高级结构与功能的关系提供理论依据。

关 键 词:金纹细蛾  几丁质酶  生物信息学分析  理化性质  系统发育树

Bioinformatical Analysis of Chitinase Gene from Lithocolletis ringoniella
Fan Xiaojun Song Zhifang Xian Xiaoxiao Li Yao Zhao Qiuyong. Bioinformatical Analysis of Chitinase Gene from Lithocolletis ringoniella[J]. Genomics and Applied Biology, 2013, 0(1): 91-96
Authors:Fan Xiaojun Song Zhifang Xian Xiaoxiao Li Yao Zhao Qiuyong
Affiliation:Fan Xiaojun Song Zhifang Xian Xiaoxiao Li Yao Zhao Qiuyong * Department of Biological and Pharmaceutical Engineering, College of Chemical Engineering and Technology, Taiyuan University of Technology, Taiyuan, 030024
Abstract:
Keywords:
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