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血清白蛋白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系
引用本文:齐燕姣,陆会宁,金能智.血清白蛋白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系[J].生物信息学,2017,15(1):59-68.
作者姓名:齐燕姣  陆会宁  金能智
作者单位:西北民族大学榆中校区化工学院, 兰州 730124,西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院, 兰州 730124,甘肃省计算中心, 兰州 730000
摘    要:莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一。分析莪术醇与转运蛋白—血清白蛋白之间的相互作用能够帮助研究者更好的理解药物的作用机制。本文通过用多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术醇与人血清白蛋白相互作用位点及其在其他亲缘关系较近的物种中的特点。结果表明,莪术醇与人血清白蛋白相互作用的结合位点II和III处周围几乎都是疏水性的氨基酸,分子间的疏水作用起着很重要的作用,其最低结合能分别是-7.22 Kcal/mol和-8.34 Kcal/mol。莪术醇与人血清白蛋白之间的作用位点在其他亲缘关系较近的狼(Canis lupus)、绵羊(Ovine)、牦牛(Bos mutus)、家牛(Bos Taurus)物种中都较为保守,少数有变化的氨基酸基本是在极性相同的氨基酸之间发生的。与分子相互作用前的结构相比,莪术醇中的羟基的结构在活性位点处发生了最明显的变化。

关 键 词:莪术醇    血清白蛋白    相互作用    序列比对    亲缘关系
收稿时间:2016/8/18 0:00:00
修稿时间:2016/11/8 0:00:00

Interaction analysis of the curcumol and homo sapiens serum albumin
QI Yanjiao,LU Huining and JIN Nengzhi.Interaction analysis of the curcumol and homo sapiens serum albumin[J].China Journal of Bioinformation,2017,15(1):59-68.
Authors:QI Yanjiao  LU Huining and JIN Nengzhi
Institution:Department of Chemical Engineering, Northwest University for Nationalities, Lanzhou 730124, China,Department of Life Sciences and Biological Engineering, Northwest University for Nationalities, Lanzhou 730124, China and Gansu Province Computing Center, Lanzhou 730000, China
Abstract:
Keywords:Curcumol  Serum albumin  Interaction  Sequence alignment  Phylogenetic relationships
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