| 副格氏乳杆菌IMAU FB017的遗传背景和益生相关基因分析 |
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| 引用本文： | 刘旭,李伟程,王可欣,孙志宏,孙天松.副格氏乳杆菌IMAU FB017的遗传背景和益生相关基因分析[J].微生物学报,2023,63(4):1630-1644. |
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| 作者姓名： | 刘旭 李伟程 王可欣 孙志宏 孙天松 |
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| 作者单位： | 1 内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室, 内蒙古 呼和浩特 010018;2 农业农村部奶制品加工重点实验室, 内蒙古 呼和浩特 010018;3 内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室, 内蒙古 呼和浩特 010018 |
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| 基金项目： | 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系资助 |
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| 摘 要： | 【目的】副格氏乳杆菌(Lactobacillus paragasseri)作为格式乳杆菌(Lactobacillus gasseri)的近源物种，是肠道、生殖道重要菌种之一。本研究团队前期发现L. paragasseri IMAU FB017具有良好的胃酸和胆盐耐受性，拟从基因组水平解析IMAU FB017的遗传背景和功能基因特征，并挖掘潜在益生特性基因，为其开发利用奠定遗传学基础。【方法】采用Nanopore和Illumina两种测序技术完成了IMAUFB017全基因组测序及完成图组装，并结合NCBI已公开的18株L.paragasseri基因组序列进行比较基因组学分析。利用Roary软件识别核心基因集与泛基因集；采用Rapid Annotation using Subsystem Technology (RAST)网站对基因组进行功能注释，以探究IMAU FB017基因组特征。【结果】结果显示IMAU FB017基因组包含1条环状染色体和1个质粒，其中环状染色体大小为1 880 023 bp,GC含量为34.90%，包含1 851个蛋白质编码区(protein-coding seq...
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| 关 键 词： | 副格氏乳杆菌 比较基因组学 胞外多糖 耐酸耐胆盐 |
| 收稿时间： | 2022/9/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/11/7 0:00:00 |
Genetic background and analysis of probiotics related genes in Lactobacillus paragasseri IMAU FB017 |
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| LIU Xu,LI Weicheng,WANG Kexin,SUN Zhihong,SUN Tiansong.Genetic background and analysis of probiotics related genes in Lactobacillus paragasseri IMAU FB017[J].Acta Microbiologica Sinica,2023,63(4):1630-1644. |
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| Authors: | LIU Xu LI Weicheng WANG Kexin SUN Zhihong SUN Tiansong |
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| Institution: | 1 Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, Inner Mongolia, China;2 Key Laboratory of Dairy Products Processing, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, Inner Mongolia, China;3 Inner Mongolia Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, Inner Mongolia, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lactobacillus paragasseri comparative genomics exopolysaccharides acid and bile salt resistance |
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