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基于蒙特卡洛模拟分析不同基因集方法的效能
引用本文:曹文君,陈长生,徐勇勇,李运明,谭志军. 基于蒙特卡洛模拟分析不同基因集方法的效能[J]. 现代生物医学进展, 2010, 10(10)
作者姓名:曹文君  陈长生  徐勇勇  李运明  谭志军
作者单位:1. 第四军医大学卫生统计学教研室,陕西,西安,710032;长治医学院基础部,山西,长治,046000
2. 第四军医大学卫生统计学教研室,陕西,西安,710032
基金项目:国家自然科学基金,陕西省科技计划项目
摘    要:目的:探索差异表达基因集(DEGs)筛选的有效方法.方法:基于蒙特卡洛模拟比较Efron's GSA、SAFE、Globaltest、PCOT2等四种基因集方法在分析微阵列数据时的统计推断能力.结果:Globaltest和PCOT2两种基于模型构建的基因集方法在处理模拟微阵列数据时效能相当,Globaltest略优于PCOT2,而Effort's GSA、SAFE方法检验效能低下.结论:Globaltest是一种较有效的微阵列数据分析方法.

关 键 词:基因集分析  微阵列数据  差异表达基因集  统计推断

Effect Analysis on Different GSA Methods Based on Monte Carlo Simulation
CAO Wen-jun,CHEN Chang-sheng,XU Yong-yong,LI Yun-ming,TAN Zhi-jun. Effect Analysis on Different GSA Methods Based on Monte Carlo Simulation[J]. Progress in Modern Biomedicine, 2010, 10(10)
Authors:CAO Wen-jun  CHEN Chang-sheng  XU Yong-yong  LI Yun-ming  TAN Zhi-jun
Abstract:
Keywords:
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