口蹄疫病毒株China/99L区段核苷酸序列测定及比较分析 |
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引用本文: | 张显升,赵启祖,刘在新,刘相涛,常惠芸,江鹏斐,陈应理,李冬,魏怀录,谢庆阁. 口蹄疫病毒株China/99L区段核苷酸序列测定及比较分析[J]. 中国病毒学, 2002, 17(2): 158-162 |
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作者姓名: | 张显升 赵启祖 刘在新 刘相涛 常惠芸 江鹏斐 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 |
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作者单位: | 中国农业科学院兰州兽医研究所,兰州,730046 |
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基金项目: | 国家“973”项目资助(G19990119;G1999011901) |
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摘 要: | 以口蹄疫病毒株China/99 RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy载体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用电泳、PCR ampos和EcoR1酶切法鉴定.该毒株与A10、O-1K、O1C ampos和TW45毒株的核苷酸序列差异率分别为15.27%、15.56%、15.56%和15.49%;氨基酸序列差异率分别为8.29%、8.76%、9.22%和10.14%.五个毒株的L/P1连接处均为苷氨酸(Gly)/异亮氨酸(Ile).序列比较表明,T-C、A-G和A-C转换率较高,是点突变的热点核苷酸,是影响氨基酸稳定的因素之一.第43-53、95-105、108-111、146-153、161-173、183-188和182-187区域极有可能是L蛋白酶的活性中心,第48位的H、51的C、65位的E、95位的H、109位的H、138位的H、148位的H和165位的E可能是L蛋白酶的活性位点,它们在维持蛋白质的空间构像和功能方面具有重要作用.
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关 键 词: | 口蹄疫病毒 L基因 序列比较分析 |
文章编号: | 1003-5125(2002)02-0158-05 |
修稿时间: | 2001-08-16 |
Sequence Comparison and Analysis of L Gene from A Foot-and-month Disease Virus Strain China/99 |
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Abstract: | |
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