基于转录组的冬虫夏草菌微循环产孢研究 |
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引用本文: | 石萍,鲁增辉,游华建,贺元川,陈仕江,邢康康,张德利,谭发银,李晓明.基于转录组的冬虫夏草菌微循环产孢研究[J].微生物学杂志,2020(6):66-74. |
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作者姓名: | 石萍 鲁增辉 游华建 贺元川 陈仕江 邢康康 张德利 谭发银 李晓明 |
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作者单位: | 1.重庆市中药研究院 冬虫夏草研究所,重庆 400065;1.重庆市中药研究院 冬虫夏草研究所,重庆 400065;2.重庆太极实业(集团)股份有限公司,重庆 408099 |
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基金项目: | 重庆市科技局基础研究与前沿探索项目(cstc2017jcyjAX0297);重庆市科技局技术创新与应用发展项目(cstc2018jscxmsybX0244);重庆市科技局社会事业与民生保障科技创新专项(cstc2017shmsA130017);重庆市科技局科研机构绩效激励引导专项(cstc2018jxjl130068) |
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摘 要: | 为研究冬虫夏草菌(Ophiocordyceps sinensis)微循环产孢过程中的分子机理,采用高通量测序技术,对微循环产孢前后冬虫夏草菌的转录组进行研究。筛选获得差异表达基因6 902个。Gene Ontology(GO)功能聚类分析表明,差异表达基因主要参与分子功能、胞内运输、核糖核蛋白复合体等生物学通路。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)功能富集分析结果表明,差异表达基因参与了核糖体、嘧啶代谢、蛋白酶体、嘌呤代谢、甘氨酸代谢等过程。Mmc、Mcb、MaH1、MaPP5、MaAGA、Pyk等候选基因不同程度的参与了冬虫夏草菌微循环产孢过程,其中Mcb家族基因可能起到关键作用。通过qRT PCR验证差异表达基因,定量结果与转录组测序结果一致。本研究为进一步揭示冬虫夏草菌微循环产孢分子机制以及关键基因的调控提供了重要信息。
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关 键 词: | 冬虫夏草菌 微循环产孢 转录组 差异基因 |
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