5例前列腺癌T细胞受体β链CDR3的多样性分析 |
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引用本文: | 潘卫兵,朱鹏,曾启昂,王凯,刘松.5例前列腺癌T细胞受体β链CDR3的多样性分析[J].中国生物工程杂志,2019,39(3):7-12. |
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作者姓名: | 潘卫兵 朱鹏 曾启昂 王凯 刘松 |
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作者单位: | Research Center for Clinical Medicine of Shenzhen Hospital, Shenzhen 518118,China |
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基金项目: | * 深圳市坪山新区医疗卫生发展孵化资助(201608);深圳市科技创新委员会知识创新计划基础研究资助项目(JCYJ20140416095712714) |
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摘 要: | T淋巴细胞受体(TCRs)在抗原识别免疫应答中作用重要,其多样性与宿主免疫反应及肿瘤预后判断密切相关。目的:采用高通量测序技术研究前列腺癌组织和癌旁组织中T细胞受体(TCR)克隆多样性及其克隆序列。方法:收集5例PC患者的癌组织和癌旁组织,提取DNA后经多重PCR技术对TCRβ链CDR3区进行扩增。用Illumina MiSeq进行测序,经过数据处理和比对分析,比较前列腺癌组织TCR CDR3组库的组成特征。结果:前列腺癌组织具有更高程度的克隆百分比和较高的高度扩增克隆比HEC(HEC:频率样本总读数的0. 5%的TCR克隆),并获得了24对在癌组织样本中差异表达的V-J基因组合、16对在癌旁组织样本中差异表达的V-J基因组合。结论:前列腺癌组织与癌旁组织均存在差异性的V-J基因组合以及高克隆表达的HEC,其中癌组织样品具有更高的HEC。PC发生发展对免疫学研究提供了新的数据,对PC免疫监视、T细胞受体变异标志等研究提供了参考,对以后继续研究打下了基础。
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关 键 词: | 前列腺癌 Tcell受体 免疫组库 高通量测序 |
收稿时间: | 2018-08-09 |
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