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亚成体大熊猫肠道真菌多样性
引用本文:艾生权,钟志军,彭广能,王承东,罗永久,何廷美,谷武阳,李才武,李刚诗,吴虹林,刘学涵,夏玉,刘艳红,周潇潇. 亚成体大熊猫肠道真菌多样性[J]. 微生物学报, 2014, 54(11): 1344-1352
作者姓名:艾生权  钟志军  彭广能  王承东  罗永久  何廷美  谷武阳  李才武  李刚诗  吴虹林  刘学涵  夏玉  刘艳红  周潇潇
作者单位:四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;中国林业科学研究院大熊猫研究中心四川雅安碧峰峡基地,四川雅安625007;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;中国林业科学研究院大熊猫研究中心四川雅安碧峰峡基地,四川雅安625007;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;中国林业科学研究院大熊猫研究中心四川雅安碧峰峡基地,四川雅安625007;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;中国林业科学研究院大熊猫研究中心四川雅安碧峰峡基地,四川雅安625007;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014;四川农业大学动物医学院,动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014
基金项目:国家自然科学基金(31272620);教育部“长江学者和创新团队发展规划”创新团队项目(IRT0848)
摘    要:【目的】分析5只亚成体大熊猫肠道真菌的多样性。【方法】采用基于ITS基因的RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)方法,对肠道真菌总DNA进行ITS-RFLP分析,构建ITS克隆文库,然后用HhaI、HaeIII进行酶切指纹图谱分析,测序并绘制系统进化树。【结果】研究表明,5只亚成体大熊猫肠道真菌主要由Ascomycota(平均占46.24%)、Basidiomycota(平均占15.79%)2个门和一些未分类(平均占29.14%)、未培养(平均占8.83%)的真菌。其中,Ascomycota主要以Saccharomycetes(平均占63.74%)和Dothideomycetes(平均占35.91%)2个纲为主;Basidiomycota主要以Tremellomycetes(平均占65.80%)和Microbotryomycetes(平均占33.15%)2个纲为主。而这4个纲分别则主要以Candida、Debaryomyces;Pleosporales、Myriangium;Cystofilobasidium、Trichosporon;Leucosporidium、Leucosporidiella八个菌属为主,各样品中所占比例不等。【结论】亚成体大熊猫肠道内存在一定比例的真菌菌群,且ITS-RFLP技术能够很好地对其多样性进行分析。真菌的发现扩大了我们对大熊猫肠道微生物结构的了解,同时也有助于我们进一步研究真菌能否帮助大熊猫消化高纤维素食物。

关 键 词:大熊猫  ITS序列  多样性  肠道真菌  RFLP分析
收稿时间:2014-02-17
修稿时间:2014-06-20

Intestinal fungal diversity of sub-adult giant panda
Shengquan Ai,Zhijun Zhong,Guangneng Peng,Chengdong Wang,Yongjiu Luo,Tingmei He,Wuyang Gu,Caiwu Li,Gangshi Li,Honglin Wu,Xuehan Liu,Yu Xi,Yanhong Liu and Xiaoxiao Zhou. Intestinal fungal diversity of sub-adult giant panda[J]. Acta microbiologica Sinica, 2014, 54(11): 1344-1352
Authors:Shengquan Ai  Zhijun Zhong  Guangneng Peng  Chengdong Wang  Yongjiu Luo  Tingmei He  Wuyang Gu  Caiwu Li  Gangshi Li  Honglin Wu  Xuehan Liu  Yu Xi  Yanhong Liu  Xiaoxiao Zhou
Abstract:
Keywords:
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