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我国分离的盖塔病毒衣壳蛋白基因和3'非翻译区分子特征研究
引用本文:翟友刚,王焕琴,付士红,梁国栋. 我国分离的盖塔病毒衣壳蛋白基因和3'非翻译区分子特征研究[J]. 病毒学报, 2007, 23(4): 270-275
作者姓名:翟友刚  王焕琴  付士红  梁国栋
作者单位:中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京,100052;中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京,100052;中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京,100052;中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京,100052
摘    要:对我国海南省和河北省分离到的3株盖塔病毒(GETV)(M1、HB0215-3和HB0234)进行衣壳蛋白基因和3'UTR区序列测定,并分析比较该病毒的分子生物学遗传特征.首先应用逆转录聚合酶链反应扩增出病毒衣壳蛋白基因和3'UTR片段,纯化后连接到载体中进行测序,然后用Clastal X和DNASTAR软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用MEGA软件绘制系统发生树.3株病毒衣壳蛋白基因分别由801、804和804个核苷酸组成,分别编码267、268和268个氨基酸,3株病毒之间核苷酸和氨基酸序列同源性为97.6%~100%和97.8%~100%,与其他GETV分离株核苷酸同源性在95.4%~99.6%之间.3株病毒3'UTR分别由411、401和401个核苷酸组成,发现中国株存在10个(45~54位)核苷酸缺失和2个(64位、148位)特有的核苷酸位点.进化分析表明盖塔病毒之间的进化关系与分离年代相关,中国境内流行的盖塔病毒是相对独立的一个类群.

关 键 词:盖塔病毒  衣壳蛋白基因  3’非翻译区  核苷酸序列  系统发生树
文章编号:1000-8721(2007)04-0270-06
修稿时间:2007-02-15

Molecular Analysis on the Capsid Gene and 3' Untranslation Region of Three Getah Viruses Isolated in China
ZHAI You-gang,WANG Huan-qing,FU Shi-hong,LIANG Guo-dong. Molecular Analysis on the Capsid Gene and 3' Untranslation Region of Three Getah Viruses Isolated in China[J]. Chinese journal of virology, 2007, 23(4): 270-275
Authors:ZHAI You-gang  WANG Huan-qing  FU Shi-hong  LIANG Guo-dong
Abstract:
Keywords:
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