| 线虫核糖核蛋白基因内含子与相应编码序列的相互作用 |
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| 引用本文： | 赵小庆,李宏,包通拉嘎.线虫核糖核蛋白基因内含子与相应编码序列的相互作用[J].生物化学与生物物理进展,2010,37(9):1006-1015. |
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| 作者姓名： | 赵小庆 李宏 包通拉嘎 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学物理科学与技术学院，呼和浩特 010021;内蒙古大学物理科学与技术学院，呼和浩特 010021;内蒙古大学物理科学与技术学院，呼和浩特 010021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30660044) |
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| 摘 要： | 对线虫核糖核蛋白基因内含子序列与相应编码序列采用Smith-Waterman方法做局域比对分析，探讨两者之间的相互作用机制．发现内含子中部序列确实存在与相应编码序列的相互作用区域．第一内含子的最佳匹配分布在内含子15%～55%的区域内，第二内含子的最佳匹配分布在内含子30%～80%的区域内．对于长内含子，在与外显子序列比对时，最佳匹配分布在内含子5%～20% 区域内，在与整个编码序列比对时，出现了两个峰区，一个位于内含子15%～30%区域内，另一个位于内含子54%～78%区域内．推测第一个峰区与外显子内部序列有关，第二个峰区与外显子-外显子结合区域的序列有关．还发现编码序列上存在多个与内含子序列的相互作用域和一些禁配区域分布．推测这些禁配区域与蛋白质结合区域有关．结论印证了内含子序列与相应编码序列协同进化的观点．
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| 关 键 词： | 线虫核糖核蛋白基因，内含子，编码序列，局域比对，相互作用 |
| 收稿时间： | 4/7/2010 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 6/9/2010 12:00:00 AM |
Interactions Between Introns and Corresponding Protein Coding Sequences of Ribosomal Protein Genes in C. elegans |
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| ZHAO Xiao-Qing,LI Hong and BAO Tonglaga.Interactions Between Introns and Corresponding Protein Coding Sequences of Ribosomal Protein Genes in C. elegans[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2010,37(9):1006-1015. |
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| Authors: | ZHAO Xiao-Qing LI Hong and BAO Tonglaga |
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| Institution: | School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China;School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China;School of Physical Science and Technology, Inner Mongolia University, Hohhot 010021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | C elegans ribosomal genes introns protein coding sequences local alignment interaction |
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