烟曲霉cyp51A基因序列BLAST数据库的建立CSCD |
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引用本文: | 洪翩翩,陈玉萍,郑楠,刘沐桑.烟曲霉cyp51A基因序列BLAST数据库的建立CSCD[J].中国真菌学杂志,2022(5):353-358. |
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作者姓名: | 洪翩翩 陈玉萍 郑楠 刘沐桑 |
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作者单位: | 1.中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所210042;2.南京大学医学院210093; |
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基金项目: | 国家自然科学基金青年基金(81501726);江苏省自然科学基金青年基金(BK20150069);中国医学科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费临床与转化医学研究基金项目(2019XK320077)。 |
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摘 要: | 目的构建我国烟曲霉cyp51A基因序列BLAST数据库。方法对本课题组收集的143株耐药与非耐药临床烟曲霉进行cyp51A基因测序,使用BLAST工具包汇总测序结果,构建本地数据库。结果此BLAST数据库包含143株耐药与非耐药烟曲霉cyp51A基因序列,以1株耐药与1株非耐药待测烟曲霉标本的cyp51A序列对此数据库进行检索和比对可以确定烟曲霉cyp51A基因型。结论本数据库有望用于cyp51A基因的检索与比对,鉴定烟曲霉cyp51A耐药基因型。
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关 键 词: | 烟曲霉 cyp51A 唑类耐药 BLAST检索 数据库 |
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