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| 拟黑多刺蚁雌激素相关受体基因cDNA的克隆及生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 欧阳霞辉,赵有红,侯兰新,奚耕思.拟黑多刺蚁雌激素相关受体基因cDNA的克隆及生物信息学分析[J].昆虫学报,2010,53(5):587-595. |
| 作者姓名： | 欧阳霞辉 赵有红 侯兰新 奚耕思 |
| 作者单位： | 1. 西北民族大学生命科学与工程学院,兰州,730030;陕西师范大学生命科学学院,西安,710062 2. 甘肃省妇幼保健院,兰州,730050 3. 西北民族大学生命科学与工程学院,兰州,730030 4. 陕西师范大学生命科学学院,西安,710062 |
| 基金项目： | 陕西省自然科学基金项目 |
| 摘 要： | 雌激素相关受体（estrogen related receptors, ERRs）能够直接与类固醇激素受体共激活子（steroidhormone receptor coactivator,SRC）结合,激活靶基因的表达,与众多生理和发育过程有关.采用RT-PCR、RACE等方法从拟黑多刺蚁Polyrhachis vicina Roger克隆得到了雌激素相关受体基因的cDNA克隆,命名为pvERR （GenBank 登录号为EF474463）,并采用生物信息学方法对其cDNA和编码的蛋白质的理化性质、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行了预测和推断.结果表明：pvERR基因cDNA全长1 935 bp,包含一个1 305 bp的开放阅读框、245 bp的5′-UTR 和385 bp的3′-UTR,编码一个由434个氨基酸组成的蛋白质.pvERR的配体结合区（ligand binding domain,LBD）主要由两个β折叠和11个α螺旋（H1, H3～H12, 缺少H2）构成,这与哺乳类动物已知晶体结构的ERRγ的配体结合区结构非常相似.pvERR氨基酸序列与其他昆虫ERRs氨基酸序列同源性很高,它与西方蜜蜂Apis mellifera雌激素相关受体amERR氨基酸序列相似性达到89.9 %;在进化关系上,pvERR与人类Homo sapiens ERRs的关系比果蝇Drosophila melanogaster雌激素相关受体dERR与人类的更近.本文可为进一步研究pvERR在昆虫发育中的功能提供有价值的信息. |
| 关 键 词： | 拟黑多刺蚁 pvERR 分子克隆 生物信息学分析 蛋白质结构预测 |
Cloning and bioinformatic analysis of cDNA of estrogen related receptor gene from Polyrhachis vicina Roger (Hymenoptera:Formicidae) |
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| OUYANG Xia-Hui,ZHAO You-Hong,HOU Lan-Xin,XI Geng-Si.Cloning and bioinformatic analysis of cDNA of estrogen related receptor gene from Polyrhachis vicina Roger (Hymenoptera:Formicidae)[J].Acta Entomologica Sinica,2010,53(5):587-595. | |
| Authors: | OUYANG Xia-Hui ZHAO You-Hong HOU Lan-Xin XI Geng-Si |
| Abstract: | |
| Keywords: | pvERR |
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