| 构建和评估猪氨基酰化酶I的三维结构 |
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| 引用本文： | 刘志刚,邓 贝,杨 波,胡 征.构建和评估猪氨基酰化酶I的三维结构[J].生物信息学,2013,11(2):130-135. |
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| 作者姓名： | 刘志刚 邓 贝 杨 波 胡 征 |
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| 作者单位： | 湖北工业大学生物工程学院,湖北武汉,430068 |
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| 基金项目： | 湖北省教育厅基金项目(项目编号：Q20081411)湖北工业大学高层次人才基金项目(项目编号：20062016) |
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| 摘 要： | 运用同源模建的方法构建了pACY1三维结构模型,并在能量最小化后对模型进行分子动力学模拟和结构合理性评估。同源模建生成了50个原始模型,经过PROCHECK评测后,筛选出模型A、B进行能量最小化,并得到模型A1、B1。分子动力学模拟结果表明模型B1二聚体结构较稳定。PROCHECK、ProSa以及WHATIF检测结果验证了模型B1属于合理性结构。得到的猪氨基酰化酶Ⅰ(pACY1)的三维结构,为研究其结构与功能关系打下基础。
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| 关 键 词： | 氨基酰化酶Ⅰ 同源模建 能量最小化 分子动力学模拟 |
| 收稿时间： | 2012/8/22 0:00:00 |
| 修稿时间： | 9/7/2012 12:00:00 AM |
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