| 荷花 PIN 基因家族的鉴定及非生物胁迫表达分析 |
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| 引用本文： | 程志鹏,汪仲毅,匡健华,赵晗茜,陈龙清,胡慧贞.荷花 PIN 基因家族的鉴定及非生物胁迫表达分析[J].西北植物学报,2024,44(1):1-12. |
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| 作者姓名： | 程志鹏 汪仲毅 匡健华 赵晗茜 陈龙清 胡慧贞 |
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| 作者单位： | 西南林业大学园林园艺学院,西南林业大学园林园艺学院,西南林业大学园林园艺学院,西南林业大学园林园艺学院,西南林业大学园林园艺学院,西南林业大学园林园艺学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金地区科学基金项目（32360070）；云南省科技厅重大科技专项计划（202202AE090028）；云南省高层次人才引进计划高端外国专家专项（YNQR-GDWG-2020-001）；云南省农业基础联合面上项目（202101BD070001-124）；云南省教育厅科学研究基金项目（2023Y0748） |
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| 摘 要： | 【目的】探究荷花中NnPIN家族成员的特征及在非生物胁迫响应中的作用，为荷花抗逆新品种的选育提供新的基因资源。【方法】采用生物信息学方法对荷花NnPIN家族进行全基因组鉴定，并通过qRT-PCR技术分析了其在低温(4℃)、水淹及外源3 mmol/L脱落酸(ABA)处理下的表达模式。【结果】(1)荷花基因组中共鉴定出12个具跨膜结构域的NnPIN基因，分别命名为NnPIN1～12,且分布在6条染色体上，并主要定位于质膜和内质网；(2)系统进化分析表明，NnPIN蛋白可根据中央亲水环的长度分为经典型和非经典型2种类型，且同一类型具相似结构；经典型具完整的motif 1～12,而非经典型则缺失中央亲水环部分(motif 6,8,9,12);(3)NnPIN基因在启动子区域具有大量光响应、非生物胁迫和激素响应元件，并特异性地具有厌氧、脱落酸(ABA)、低温等响应元件；(4)NnPIN基因(除NnPIN8外)均正向响应外源ABA和低温胁迫，而NnPIN6和NnPIN7正向响应水淹胁迫，NnPIN1、NnPIN2、NnPIN3、NnPIN4、NnPIN5、NnPIN8、NnPIN9和NnPIN12...
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| 关 键 词： | 荷花 PIN基因家族 生物信息学 非生物胁迫 表达模式 |
| 收稿时间： | 2023/8/1 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/9/25 0:00:00 |
Genome-wide identification and expression pattern of the PIN gene family under various abiotic stresses in Lotus (Nelumbo nucifera G.) |
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| CHENG Zhipeng,WANG Zhongyi,KUANG Jianhu,ZHAO Hanqian,CHEN Longqing and HU Huizhen.Genome-wide identification and expression pattern of the PIN gene family under various abiotic stresses in Lotus (Nelumbo nucifera G.)[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2024,44(1):1-12. |
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| Authors: | CHENG Zhipeng WANG Zhongyi KUANG Jianhu ZHAO Hanqian CHEN Longqing and HU Huizhen |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | lotus PIN gene family bioinformatics abiotic stress expression pattern |
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