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应用超高分辨双向凝胶电泳技术进行正常人类肝脏蛋白质组研究
作者姓名:米薇  刘新  贾伟  李蕾  蔡耘  应万涛  钱小红
作者单位:中国计量科学研究院生物能源环境所, 北京 100013;
军事医学研究院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心, 蛋白质组学国家重点实验室, 北京 102206
† 同等贡献
基金项目:国家自然科学基金重点项目(批准号: 30621063, 20635010和20735005)、国家重点基础研究发展计划(批准号: 2006CB910801, 2004CB518707和2007CB914100)、国家高技术研究发展计划(批准号: 2006AA02A308和2008AA02Z309)资助项目
摘    要:肝脏是人体最大的实质器官, 承担着人体许多关键的生理功能, 在生命活动中占有重要地位. 根据人类肝脏蛋白质组计划, 本实验旨在构建人肝脏蛋白质双向凝胶电泳表达谱, 尽可能分离和鉴定更多的蛋白. 在双向凝胶电泳第一向等电聚焦水平上, 从上样方式、水化液配方、聚焦时间等方面优化了碱性蛋白的分离条件, 利用超放大胶分离技术搭建了高分辨的双向凝胶电泳分离平台, 构建了人类肝脏蛋白质2-DE参考谱, 检测到5481个蛋白质点. 这是目前国际上最为全面的人体器官蛋白质组2-DE参考谱, 为其他肝病的研究提供了较好的参照系. 成功鉴定了429个非冗余蛋白, 对pH 4.0~7.0, 5.0~6.0, 5.5~6.7, 6.0~9.0部分蛋白质点在胶上进行了注释, 由此构建了人肝2-DE蛋白质表达谱数据库. 对蛋白质的理化性质、功能及亚细胞定位进行了全面分析. 研究中构建的人类肝脏蛋白质2-DE图谱将为肝脏比较蛋白质组学研究提供参考.

关 键 词:人类肝脏蛋白质组  双向凝胶电泳  超高分辨胶  质谱
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