一种从PAXgene全血RNA管内提取基因组DNA的方法 |
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引用本文: | 杨莎莎,韩晓杰,周姗姗,王文倩,刘佳缘,徐玉东,杨永清.一种从PAXgene全血RNA管内提取基因组DNA的方法[J].现代生物医学进展,2017,17(9):1615-1618. |
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作者姓名: | 杨莎莎 韩晓杰 周姗姗 王文倩 刘佳缘 徐玉东 杨永清 |
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作者单位: | 上海中医药大学 上海市针灸经络研究所 上海 200030 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81574058,81473760);上海市中医药事业发展三年行动计划项目(ZY3-CCCX-3-3005, ZYSNXD-CC-ZDYJ039);上海市卫生和计划生育委员会科研课题(201640133) |
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摘 要: | 目的:从同一生物样本同步提取RNA和DNA,能提高样本的利用率,而且对于基因组学、转录组学和表观遗传学检测数据之间的比对和匹配分析也十分重要。本研究在不影响RNA样品制备的前提下,建立一种从PAXgene全血RNA管内提取基因组DNA的方法。方法:取一定量PAXgene全血RNA管血液样本,使用QIAamp DNA试剂盒提取血细胞基因组DNA,系统优化提取过程中的离心参数、洗脱量以及初始血液样本量等实验参数,并对提取的基因组DNA质量进行检测。结果:用PAXgene全血RNA管3 mL血液样本能够提取出8.918±1.100μg基因组DNA,紫外分光光度计检测DNA样品的OD 260/280比值为1.89±0.09,琼脂糖凝胶电泳结果显示DNA样品完整无降解。结论:利用本方法提取的DNA样品能够满足下游DNA芯片、DNA甲基化测序等实验要求。该方法有助于从有限的临床血液样本中获取全面的遗传信息,并且提高后续不同实验方法所生成数据之间的可比性和匹配度。
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关 键 词: | PAXgene全血RNA管 基因组DNA 提取方法 |
收稿时间: | 2016/10/21 0:00:00 |
修稿时间: | 2016/11/19 0:00:00 |
A Method for Extracting Genomic DNA from PAX gene Blood RNA Tube |
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Abstract: | |
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Keywords: | PAXgene Blood RNA tube Genomic DNA Extraction method |
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