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蛋白质相互作用数据库
引用本文:王建.蛋白质相互作用数据库[J].中国生物化学与分子生物学报,2017,33(8):760-767.
作者姓名:王建
作者单位:军事医学科学院放射与辐射医学研究所,国家蛋白质科学中心·北京,北京蛋白质组研究中心, 蛋白质组学国家重点实验室,北京102206
基金项目:国家重点基础研究发展计划(“973”计划, No.2014CBA02001); 国家自然科学基金(No. 31571270)和北京市青年拔尖团队项目(No. 201500021223TD04)资助
摘    要:随着“蛋白质组学”的蓬勃发展和人类对生物大分子功能机制的知识积累,涌现出海量的蛋白质相互作用数据。随之,研究者开发了300多个蛋白质相互作用数据库,用于存储、展示和数据的重利用。蛋白质相互作用数据库是系统生物学、分子生物学和临床药物研究的宝贵资源。本文将数据库分为3类:(1)综合蛋白质相互作用数据库;(2)特定物种的蛋白质相互作用数据库;(3)生物学通路数据库。重点介绍常用的蛋白质相互作用数据库,包括BioGRID、STRING、IntAct、MINT、DIP、IMEx、HPRD、Reactome和KEGG等。

关 键 词:蛋白质相互作用    蛋白质相互作用组  数据库    网络资源  
收稿时间:2017-02-10

Protein-protein Interaction Databases
Jian Wang.Protein-protein Interaction Databases[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2017,33(8):760-767.
Authors:Jian Wang
Abstract:With the rapid development of proteomics and the accumulation of knowledge about the mechanism of biological macromolecules, a large amount of protein-protein interaction data have emerged. The researchers have developed more than 300 protein-protein interaction databases for storage, display and re-use of these data. These protein-protein interactions are valuable resources for system biology, molecular biology and clinical drug development. In this review, these databases are divided into three categories: (1) General protein-protein interaction databases; (2) Specific protein-protein interaction databases; (3) Pathway and reactions databases. The protein interaction databases including BioGRID, STRING, IntAct, MINT, DIP, IMEx, HPRD, Reactome, KEGG, etc. were introduced in detail.
Keywords:protein-protein interaction  protein interactome  databases  web resources  
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