基因加倍对棉花线粒体atpA基因RNA编辑率的影响 |
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作者姓名: | 张晓 李才华 王婧 张兰兰 牟晓雨 王昕玥 甘刘美 周鹏展 张锐 |
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作者单位: | 1.长春理工大学生命科学技术学院,长春 130022;2.中国农业科学院生物技术研究所,北京 100081 |
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基金项目: | 国家自然科学基金青年基金项目(31200944);国家自然科学基金项目(31771850) |
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摘 要: | 植物线粒体基因组中存在RNA编辑(C-U)现象,且有完全编辑和部分编辑之分。棉花细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterile,CMS)系和保持系线粒体基因组中atpA基因各有两个拷贝,存在基因加倍现象,但atpA基因加倍对其RNA编辑率的影响尚不清楚。通过Southern blot、染色体步移技术确定出该基因每个拷贝具体的DNA序列,发现一个拷贝是完整的,一个拷贝是截短的。用RT-PCR、环化RT-PCR方法扩增出每个拷贝相应的cDNA,结果表明:棉花CMS系和保持系atpA基因完整拷贝和截短型拷贝都转录。完整拷贝、截短型拷贝中分别存在6、4个RNA编辑位点。完整拷贝6个RNA编辑位点在保持系中的编辑率都是100%;在CMS系中编辑率分别是100%、85%、100%、92%、100%、100%。截短型拷贝4个位点在保持系中的编辑率分别是55%、37%、55%、27%;在CMS系中编辑率分别是100%、90%、100%、100%。据此推测截短型拷贝在保持系中承受选择压较小,很可能已失去功能;而在CMS系中仍承受较大选择压,很可能具有新的功能。
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关 键 词: | 棉花 线粒体基因组 atpA 基因加倍 RNA编辑 |
收稿时间: | 2022-03-18 |
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