| SARS-CoV-2病毒感染潜在关键分子生物标志物及免疫浸润特征分析 |
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| 引用本文： | 于敏,王敏,魏延焕,刘毅毅. SARS-CoV-2病毒感染潜在关键分子生物标志物及免疫浸润特征分析[J]. 生物技术进展, 2022, 12(5): 760-768. DOI: 10.19586/j.2095-2341.2022.0067 |
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| 作者姓名： | 于敏 王敏 魏延焕 刘毅毅 |
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| 作者单位： | 1.日照市人民医院急诊医学科，山东 日照 276800;2.海军军医大学第三附属医院检验科，上海 200438 |
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| 摘 要： | 应用生物信息学方法筛选新型冠状病毒肺炎（corona virus disease 2019,COVID-19）感染的潜在关键分子生物标志物并分析其免疫浸润特征。从GEO数据库下载GSE152418数据集，其中COVID-19患者17例，健康对照17例。用加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）方法筛选出COVID-19最相关的模块基因。与差异基因取交集得到共同基因，进行功能及信号通路富集分析，构建蛋白互作网络筛选关键基因，构建关键基因的miRNATF-mRNA调控网络，用CIBERSORT算法预测样本免疫细胞浸润特征。差异分析得到2 049个差异基因。WGCNA分析7个模块中“土耳其蓝色”模块与COVID-19相关性最高（r=0.91,P<0.001）。模块中基因显著性和模块隶属度呈显著正相关（r=0.96,P<0.001）。得到共同基因766个，主要参与有丝分裂、微管结合、阳离子通道活性及卵母细胞减数分裂、细胞衰老等。蛋白互作网络筛选到前10位关键基因分别为CDK1、BUB1、CCNA2...
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| 关 键 词： | 新型冠状病毒肺炎 生物标志物 免疫浸润 生物信息学 感染 |
| 收稿时间： | 2022-05-05 |
Analysis of Potential Key Molecular Biomarkers and Immune Infiltration Characteristics of SARS-CoV-2 Virus Infection |
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| Min YU,Min WANG,Yanhuan WEI,Yiyi LIU. Analysis of Potential Key Molecular Biomarkers and Immune Infiltration Characteristics of SARS-CoV-2 Virus Infection[J]. CURRENT BIOTECHNOLOGY, 2022, 12(5): 760-768. DOI: 10.19586/j.2095-2341.2022.0067 |
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| Authors: | Min YU Min WANG Yanhuan WEI Yiyi LIU |
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| Affiliation: | 1.Department of Emergency Medicine，Rizhao People's Hospital，Shandong Rizhao 276800，China;2.Department of Laboratory Medicine，the Third Affiliated Hospital of Naval Military Medical University，Shanghai 200438，China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | COVID-19 biomarkers immune infiltration bioinformatics infection |
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