| 荔枝果实酸性转化酶LcSAI生物信息学和表达分析 |
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| 引用本文： | 董 晨,魏永赞,王 弋,郑雪文,李伟才.荔枝果实酸性转化酶LcSAI生物信息学和表达分析[J].广西植物,2021,41(6):989-996. |
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| 作者姓名： | 董 晨 魏永赞 王 弋 郑雪文 李伟才 |
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| 作者单位： | 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农村农业部热带果树生物学重点实验室, 广东 湛江 524091 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2019YFD1000900); 中央级公益性科研院所基本科研业务专项(1630062021010); 国家荔枝龙眼产业技术体系(CARS-32-20); 广东省自然科学基金(2018A030307012)[Supported by the National Key R & D Program of China(2019YFD1000900); Special Program of Central Public Research Institutes for Basic Research(1630062021010); China Litchi and Longan Industry Technology Research System(CARS-32-20); Natural Science Foundation of Guangdong Province(2018A030307012]。 |
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| 摘 要： | 酸性转化酶作为蔗糖代谢中的关键酶,在还原糖积累型荔枝中表达及酶活性显著高于蔗糖积累型荔枝。为了全面了解酸性转化酶的生物学特征,该文通过运用生物信息学方法对荔枝果实酸性转化酶LcSAI基因的基本理化性质、蛋白二级结构、亲水性/疏水性、跨膜结构域、信号肽、磷酸化位点、保守结构域、系统进化进行系统的分析;利用qRT-PCR技术对LcSAI在'妃子笑'不同组织和果实不同发育阶段进行表达分析。结果表明:(1)荔枝果实酸性转化酶为定位于液泡的亲水性不稳定蛋白,无信号肽,其蛋白的二级结构主要有无规则卷曲和延伸链构件,并散布于整个蛋白;(2)在N-端含有一个跨膜区,包含两个保守结构域,位于N-端的Pfam DUF3357结构域和Glyco_32结构域,属于糖基水解酶基因家族32超家族;(3)系统进化分析结果显示LcSAI与龙眼酸性转化酶基因同源,不同组织间LcSAI表达水平为雄花根嫩茎种子嫩叶雌花果皮老叶,果实不同发育阶段LcSAI表达具有特异性。该研究为深入研究LcSAI果实酸性转化酶基因调控蔗糖代谢途径机理提供数据依据。
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| 关 键 词： | 荔枝 酸性转化酶 生物信息学 表达分析 |
| 收稿时间： | 2020/1/19 0:00:00 |
Bioinformatics and expression analysis of acid
invertase LcSAI of Litchi chinesis |
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| DONG Chen,WEI Yongzan,WANG Yi,ZHENG Xuewen,LI Weicai.Bioinformatics and expression analysis of acid
invertase LcSAI of Litchi chinesis[J].Guihaia,2021,41(6):989-996. |
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| Authors: | DONG Chen WEI Yongzan WANG Yi ZHENG Xuewen LI Weicai |
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| Institution: | Institute of South Subtropical Corp Research, Chinese Academy of Tropical Agricultural Science, Key Laboratory
of Tropical Fruit Biology, Ministry of Agriculture, Zhanjiang 524091, Guangdong, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Litchi chinensis acid invertase bioinformatics expression analysis |
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