| 抗菌肽BLFcin6与不同磷脂膜之间相互作用的分子动力学模拟研究 |
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| 引用本文： | 孔真真,赵立岭,唐艳,王吉华,曹赞霞. 抗菌肽BLFcin6与不同磷脂膜之间相互作用的分子动力学模拟研究[J]. 生物化学与生物物理进展, 2018, 45(3): 351-362 |
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| 作者姓名： | 孔真真 赵立岭 唐艳 王吉华 曹赞霞 |
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| 作者单位： | 德州学院,山东省生物物理省级重点实验室，德州 253023；山东师范大学生命科学学院，济南 250014,德州学院,山东省生物物理省级重点实验室，德州 253023；德州学院物理与电子信息学院，德州 253023,德州学院,山东省生物物理省级重点实验室，德州 253023；德州学院资源环境与规划学院，德州 253023,德州学院,山东省生物物理省级重点实验室，德州 253023；德州学院物理与电子信息学院，德州 253023,德州学院,山东省生物物理省级重点实验室，德州 253023；德州学院物理与电子信息学院，德州 253023 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31670727, 61671107), 山东省自然科学基金(ZR2016CQ15, ZR2014AL014)和山东省科学发展计划(2014GNC110025)资助项目 |
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| 摘 要： | 抗菌肽具有广谱抗菌特性,有望成为抗生素较好的替代产品.研究抗菌肽的抗菌机制,可以为新型抗菌肽的设计提供指导.无论抗菌肽采用哪种抗菌机制,其首先要稳定地吸附到细胞膜之上.因此,本文利用分子动力学模拟方法比较了抗菌小肽BLFcin6与5种不同细胞膜之间的相互作用.对这5种细胞膜而言,小肽会很快结合在POPG膜和DPPC-CHOL膜的表面,倾向于进入DPPC膜的疏水内部,与POPC膜和POPC-CHOL膜的接触很少.考察相互作用能,小肽与POPG膜的相互作用最强,主要是小肽与细胞膜亲水头部存在静电相互作用;小肽与DPPC膜的疏水尾部的相互作用较强,但受胆固醇影响,小肽只结合在DPPC-CHOL膜表面.在结合过程中,小肽N端的Arg会先结合到细胞膜上,静电相互作用在小肽锚定细胞膜的过程中起关键作用.以上研究从原子水平上解释了为什么BLFcin6小肽具有抗菌作用,哪些残基起关键作用,也为进一步开展BLFcin6小肽及其衍生小肽的研究奠定基础.
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| 关 键 词： | BLFcin6抗菌小肽，不同成分磷脂膜，分子动力学模拟，肽膜相互作用 |
| 收稿时间： | 2017-07-05 |
| 修稿时间： | 2017-10-11 |
Study on The Interaction Between BLFcin6 and Different Phospholipid Membrane by Molecular Dynamics Simulation |
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| KONG Zhen-Zhen,ZHAO Li-Ling,TANG Yan,WANG Ji-Hua and CAO Zan-Xia. Study on The Interaction Between BLFcin6 and Different Phospholipid Membrane by Molecular Dynamics Simulation[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 2018, 45(3): 351-362 |
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| Authors: | KONG Zhen-Zhen ZHAO Li-Ling TANG Yan WANG Ji-Hua CAO Zan-Xia |
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| Affiliation: | Shandong Provincial Key Laboratory of Biological Physics, Dezhou University, Dezhou 253023, China; School of Life Science, Shandong Normal University, Jinan 250014, China,Shandong Provincial Key Laboratory of Biological Physics, Dezhou University, Dezhou 253023, China; School of Physics and Electronic Information, Dezhou University, Dezhou 253023, China,Shandong Provincial Key Laboratory of Biological Physics, Dezhou University, Dezhou 253023, China; School of Resources Environment and Planning, Dezhou University, Dezhou 253023, China,Shandong Provincial Key Laboratory of Biological Physics, Dezhou University, Dezhou 253023, China; School of Physics and Electronic Information, Dezhou University, Dezhou 253023, China and Shandong Provincial Key Laboratory of Biological Physics, Dezhou University, Dezhou 253023, China; School of Physics and Electronic Information, Dezhou University, Dezhou 253023, China |
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