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基于23S/5SrDNA序列的柑橘黄龙病病原菌亚洲种系统发育研究
引用本文:廖惠红,白先进,李杨瑞,陈传武,杨丽涛,朱建华,徐宁. 基于23S/5SrDNA序列的柑橘黄龙病病原菌亚洲种系统发育研究[J]. 生物技术通报, 2009, 0(5)
作者姓名:廖惠红  白先进  李杨瑞  陈传武  杨丽涛  朱建华  徐宁
作者单位:1. 广西大学农学院,南宁,530004;广西农业科学院园艺研究所,南宁,530007
2. 广西农业科学院,南宁,530007
3. 广西大学农学院,南宁,530004;广西农业科学院,南宁,530007
4. 广西柑橘研究所,桂林,541004
5. 广西大学农学院,南宁,530004
6. 广西农业科学院园艺研究所,南宁,530007
基金项目:广西壮族自治区人才小高地项目 
摘    要:根据柑橘黄龙病亚洲种23S/5S的DNA序列设计一对引物对不同地理来源的6个柑橘黄龙病样品DNA进行扩增,扩增片段大小均为1 654 bp包括一个假定细胞壁水解酶假基因(putative cell wall hydrolase pseudogene)和5S rRNA 基因.序列同源性分析结果表明;6个柑橘黄龙病病原菌样品与柑橘黄龙病病原菌亚洲种Sihui样品的同源性为99%,然而与土壤杆菌,布鲁氏菌,根瘤菌,中华根瘤菌,巴通体菌和中慢生根瘤菌的同源性只有89%~95%,说明在23S/5S rDNA序列上黄龙病病原菌亚洲种与α变形菌纲根瘤菌目的其他病原菌相差较大.对黄龙病病原菌亚洲种种内的23S/5S rDNA序列进行比较分析,结果发现黄龙病病原菌亚洲种种内之间putative cell wall hydrolase pseudogene和5S rRNA的基因序列非常保守,但不同地理来源的柑橘黄龙病样品碱基序列间确实存在差异,差异的大小与地理的远近无关.利用简约法对黄龙病病原菌亚洲种及α变形菌纲其它病原菌的23S/5S rDNA序列构建的系统发育树显示黄龙病病原菌亚洲种单独聚为一类,其他细菌聚为另一类,该结果与基于rplJ基因及16S rRNA基因的DNA序列构建的分子系统进化树结果一致.

关 键 词:柑橘  黄龙病  亚洲种

Phylogenetic Analysis of Candidatus Liberibacter Asiaticus of Citrus Huanglongbing Based on 23S/5S rDNA Sequence
Liao Huihong,Bai Xianjin,Li Yang,Chen Chuanwu,Yang Litao,Zhu Jianhua,Xu Ning. Phylogenetic Analysis of Candidatus Liberibacter Asiaticus of Citrus Huanglongbing Based on 23S/5S rDNA Sequence[J]. Biotechnology Bulletin, 2009, 0(5)
Authors:Liao Huihong  Bai Xianjin  Li Yang  Chen Chuanwu  Yang Litao  Zhu Jianhua  Xu Ning
Abstract:
Keywords:23S/5S  rDNA
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