| 上海2009甲型H1N1流行性感冒病毒全基因组分析 |
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| 引用本文： | 宋志刚,田棣,张小楠,任广旭,周志统,何静,袁正宏,胡芸文. 上海2009甲型H1N1流行性感冒病毒全基因组分析[J]. 微生物与感染, 2010, 5(4) |
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| 作者姓名： | 宋志刚 田棣 张小楠 任广旭 周志统 何静 袁正宏 胡芸文 |
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| 作者单位： | 1. 上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心,上海,201508
2. 上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心,上海,201508;复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室,上海,200032 |
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| 基金项目： | "十一五"国家科技重大专项 |
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| 摘 要： | 2009年全球暴发2009甲型H1N1流行性感冒(简称流感)疫情,上海于2009年5月出现第1例输入型病例。为了解上海地区输入型2009甲型H1N1流感病毒的生物学特征,以上海较早发现的2例输入型甲型H1N1流感患者作为研究对象,分离出A/Shanghai/37T/2009和A/Shanghai/71T/2009病毒,利用实时定量荧光反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定病毒,通过扫描透射电子显微镜观察、免疫荧光检测、全基因组测序和生物信息软件分析,对这2株流感病毒形态、结构、耐药性、基因特点和病毒型别等进行研究。结果显示,病毒呈现正黏病毒颗粒形态特征;犬肾(MDCK)细胞内的病毒能与患者恢复期血清反应。此2株病毒的全基因核酸序列和氨基酸序列与美国参考株A/California/04/2009(H1N1)有较高同源性,其中第31位氨基酸残基发生改变。对金刚烷胺耐药,而对奥司他韦敏感。基于全基因组的系统发育分析,确认此2株病毒属2009甲型H1N1流感病毒。
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| 关 键 词： | 2009甲型H1N1流行性感冒病毒 病毒分离株 核酸测序 进化树分析 |
Whole-genome analysis of 2009 influenza A virus subtype H1N1 isolates in Shanghai |
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| SONG Zhi-Gang,TIAN Di,ZHANG Xiao-Nan,REN Guang-Xu,ZHOU Zhi-Tong,HE Jing,YUAN Zheng-Hong,HU Yun-Wen. Whole-genome analysis of 2009 influenza A virus subtype H1N1 isolates in Shanghai[J]. Journal of Microbes and Infection, 2010, 5(4) |
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| Authors: | SONG Zhi-Gang TIAN Di ZHANG Xiao-Nan REN Guang-Xu ZHOU Zhi-Tong HE Jing YUAN Zheng-Hong HU Yun-Wen |
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