| 金针菇HMG-box转录因子鉴定及一个候选基因的差异表达分析 |
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| 引用本文： | 孟丽,王丽,刘芳,丑天胜,王威,谢宝贵. 金针菇HMG-box转录因子鉴定及一个候选基因的差异表达分析[J]. 菌物学报, 2018, 37(4): 466-475. DOI: 10.13346/j.mycosystema.170179 |
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| 作者姓名： | 孟丽 王丽 刘芳 丑天胜 王威 谢宝贵 |
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| 作者单位： | 1 农业大学植物保护学院 山东省农业微生物重点实验室 山东 泰安 2710182 农林大学菌物研究中心 福建 福州 350002 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划（2014CB138302）;山东省自然科学基金（ZR2016CL13）;山东省农业微生物重点实验室开放课题基金（SDKL2017015） |
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| 摘 要： | 食用菌的原基形成受到环境因子和内源基因的共同调控,转录因子在其生长发育过程中能够起到关键作用。本研究在已测序金针菇单核菌株L11全基因组中鉴定到29个高速泳动蛋白（high-mobility-group box,HMG-box）转录因子编码基因。基于金针菇双核菌株H1123各发育时期转录组数据,筛选到一个与金针菇原基形成相关的HMG-box转录因子基因Fv-hmg。通过同源比对发现Fv-hmg的DNA序列在6个不同金针菇菌株中十分保守,一致性为98.38%,有92个SNP位点。克隆分析表明,该基因长度为1 517bp,含有一个内含子。该基因编码489个氨基酸残基的蛋白序列,含有一个HMG-box结构域。通过实时荧光定量PCR和转录组测序共同分析表明,该基因在金针菇原基时期的表达量比双核菌丝时期高达4倍以上,具有显著性差异（P<0.01）,由此推测该转录因子参与调控金针菇的原基形成。HMG-box转录因子Fv-Hmg在金针菇原基形成过程中的作用仍需进一步研究。
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| 关 键 词： | 金针菇 原基形成 高速泳动蛋白 转录因子 |
| 收稿时间： | 2017-09-10 |
Identification of HMG-box transcription factors and differential expression analysis of a selected gene in Flammulina velutipes |
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| Li MENG,Li WANG,Fang LIU,Tian-Sheng CHOU,Wei WANG,Bao-Gui XIE. Identification of HMG-box transcription factors and differential expression analysis of a selected gene in Flammulina velutipes[J]. Mycosystema, 2018, 37(4): 466-475. DOI: 10.13346/j.mycosystema.170179 |
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| Authors: | Li MENG Li WANG Fang LIU Tian-Sheng CHOU Wei WANG Bao-Gui XIE |
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| Affiliation: | 1 Shandong Provincal Key Laboratory of Agricultural Microbiology, College of Plant Protection, Shandong Agricultural University, Tai’an, Shandong 271018, China2 Mycological Research Center, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China |
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| Abstract: | |
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