| 拟南芥ABC转运类蛋白家族的分子进化、表达模式和蛋白功能网络预测分析 |
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| 引用本文： | 朱璐,许杰,张大兵. 拟南芥ABC转运类蛋白家族的分子进化、表达模式和蛋白功能网络预测分析[J]. 植物生理学报, 2012, 0(12): 1151-1166 |
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| 作者姓名： | 朱璐 许杰 张大兵 |
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| 作者单位： | 上海交通大学生命科学技术学院 |
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| 基金项目： | 自然科学基金面上项目(31000593) |
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| 摘 要： | ABC转运蛋白又称腺苷三磷酸结合盒转运蛋白(ATP-binding cassette transporters),该基因家族是目前已知最大、最古老的蛋白家族之一,在植物中ABC转运蛋白种类繁多、结构复杂、功能多样,涉及植物一切的生命活动过程。本研究系统介绍了拟南芥中131个ABC转运蛋白的亚家族分类、系统命名、蛋白大小以及蛋白亚细胞定位等基因信息,在此基础上,分析了ABC转运蛋白基因在染色体分布以及进化过程中发生的复制事件;其次在47个组织器官或发育阶段中聚类分析了ABC转运蛋白的表达模式和各个亚家族分布规律,结果表明ABC转运蛋白基因的表达具有明显的组织特异性和时空特异性,说明在进化过程中该类蛋白功能也进一步发生分化;我们以花药发育过程为例,说明ABC转运蛋白在花药发育过程中具有较高的协调性,在时空和组织上表达受到严格的调控;最后我们分析了ABC转运蛋白亚家族内部和各个亚家族之间可能存在的蛋白相互作用关系,推测ABC半分子转运蛋白形成同源或异源二聚体发挥功能的可能性,进一步说明ABC转运蛋白在蛋白互作水平上也存在功能多样性和严格的调控关系。
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| 关 键 词： | 拟南芥 ABC转运蛋白 分子进化 表达分析 蛋白相互作用 |
Molecular Evolution, Expression and Functional Network Prediction Analysis of ABC Transporter Gene Family in Arabidopsis thaliana |
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| ZHU Lu, XU Jie, ZHANG Da-Bing. Molecular Evolution, Expression and Functional Network Prediction Analysis of ABC Transporter Gene Family in Arabidopsis thaliana[J]. Acta Phytophysiologica Sinica, 2012, 0(12): 1151-1166 |
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| Authors: | ZHU Lu XU Jie ZHANG Da-Bing |
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| Affiliation: | * School of Life Sciences and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China |
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