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| 改进的K—mean聚类算法在基因系统发育谱分析中的应用 | |
| 引用本文： | 马志强,孙平平,马雅楠,魏雅卓,陆林英,崔颖,周春光. 改进的K—mean聚类算法在基因系统发育谱分析中的应用[J]. 生物信息学, 2008, 6(2): 82-84 |
| 作者姓名： | 马志强 孙平平 马雅楠 魏雅卓 陆林英 崔颖 周春光 |
| 作者单位： | 1. 吉林大学计算机学院,长春,130000;东北师范大学计算机学院,长春,130117 2. 东北师范大学计算机学院,长春,130117 3. 吉林大学计算机学院,长春,130000 |
| 基金项目： | 东北师大青年自然科学基金 |
| 摘 要： | 简要介绍了系统发育谱法的原理，着重阐述了K—mean聚类算法在对基因系统发育谱分析中的改进，并与传统的K—mean聚类算法进行比较。实验结果表明，改进的K—mean聚类算法在运用系统发育谱法进行基因功能注释上是快而有效的，可以快速收敛到近似最优解。 |
| 关 键 词： | 系统发育谱 基因功能注释 K—mean聚类 |
| 文章编号： | 1672-5565(2008)-02-82-04 |
| 修稿时间： | 2007-07-12 |
Application of Improved K - mean Clustering in Analyses of Gene Phylogenetic profile |
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| MA Zhi-qiang,SUN Ping-ping,MA Ya-nan,WEI Ya-zhuo,LU Lin-ying,CUI Ying,ZHOU Chun-guang. Application of Improved K - mean Clustering in Analyses of Gene Phylogenetic profile[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2008, 6(2): 82-84 | |
| Authors: | MA Zhi-qiang SUN Ping-ping MA Ya-nan WEI Ya-zhuo LU Lin-ying CUI Ying ZHOU Chun-guang |
| Affiliation: | MA Zhi - qiang, SUN Ping - ping, MA Ya - nan, WEI Ya - zhuo, LU Lin - ying, CUI Ying, ZHOU Chun - guang ( 1. School of Computer, JiLin University, ChangChun, 130000 ; 2. School of Computer, Northeast Normal University, ChangChun, 130117 China ) |
| Abstract: | This paper describes the theory of phylogenetic profile, focuses on the amelioration of K- mean clustering algorithm in analyzing the gene phylogenefic profile,also compare with the traditional K- mean clustering algorithm. The experimental results show that the amelioratd K - mean clustering algorithm is fast and effective, and can quickly converge to the approximate optimal solution. |
| Keywords: | phylogenetic profile gone functional annotation K- mean clustering |
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