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检测博尔纳病病毒RNA的RACE技术的建立
引用本文:钱钧,李小光,包丽丽,宋武琦,翟爱霞,陈小贝,李玉军,车洋,张凤民.检测博尔纳病病毒RNA的RACE技术的建立[J].中国微生态学杂志,2007,19(4):337-338,342.
作者姓名:钱钧  李小光  包丽丽  宋武琦  翟爱霞  陈小贝  李玉军  车洋  张凤民
作者单位:哈尔滨医科大学,微生物学教研室,黑龙江,哈尔滨,150081
基金项目:国家自然科学基金;黑龙江省教育厅海外学人科研(合作)基金
摘    要:目的建立检测博尔纳病病毒(BDV)RNA的3′RACE(rapid amplification of cDNA ends)方法。方法根据已知的BDV p40基因序列设计上游引物sp1;提取BDV(H1766株)持续感染OL细胞的总RNA,用引物sp1和oligo dT进行3′RACE扩增,将PCR产物克隆到pGEM-T载体并转化到大肠埃希菌中,制备阳性菌落的目的质粒,进行序列测定和同源性比对;同时对检测BDV RNA的3′RACE方法的特异性和敏感性进行分析。结果建立了检测BDV RNA的3′RACE技术;所获得的BDV p40基因的3′末端扩增产物的核苷酸序列与已知BDV(H1766株)p40基因的核苷酸序列同源性为100%;本方法对BDV RNA(mRNA)具有特异性,但对BDV p40基因重组质粒无扩增结果;并且可以检测到0.04 ng以上含量的BDV感染细胞的总RNA。结论检测BDV RNA的3′RACE技术可以排除实验室污染造成的BDV基因扩增的假阳性,并可用于进一步分析BDV基因序列的特点以及评价BDV相关基因的表达情况。

关 键 词:博尔纳病病毒  快速cDNA末端扩增  序列分析
文章编号:1005-376X(2007)04-0337-03
收稿时间:2007-02-10
修稿时间:2007-02-10

Establishment of 3'RACE method for detection of Borna disease virus RNA
QIAN Jun,LI Xiao-guang,BAO Li-li,SONG Wu-qi,ZAI Ai-xia,CHEN Xiao-bei,LI Yu-jun,CHE Yang,ZHANG Feng-min.Establishment of 3'RACE method for detection of Borna disease virus RNA[J].Chinese Journal of Microecology,2007,19(4):337-338,342.
Authors:QIAN Jun  LI Xiao-guang  BAO Li-li  SONG Wu-qi  ZAI Ai-xia  CHEN Xiao-bei  LI Yu-jun  CHE Yang  ZHANG Feng-min
Institution:Department of Microbiology, Harbin Medical University, Harbin 150086, China
Abstract:
Keywords:Borna disease virus  Rapid amplification of cDNA ends  sequencing
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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